Lidský střevní virom, viry v krvi a rozvoj ostrůvkové autoimunity ve dvou severských novorozeneckých kohortách s vysokým rizikem diabetu 1. typu

Poskytovatel
Ministerstvo zdravotnictví
Program
Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2015 - 2023
Veřejná soutěž
Zdravotnický AV 1 (SMZ0201501)
Hlavní účastníci
Univerzita Karlova / 2. lékařská fakulta
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
15-29078A

Název projektu anglicky
The human gut virome, viruses in blood and the development of islet autoimmunity in two Nordic birth cohorts at a high risk of type 1 diabetes
Anotace anglicky
Candidate virus studies have indicated a role of viruses in initiating islet autoimmunity leading to type 1 diabetes, but no unbiased sequencing of all virus populations (virome) of the gut has been performed in this context. Our aim is to investigate the association of gut virome composition with islet autoimmunity using next-generation sequencing (NGS) followed by confirmation with specific PCR tests from stool and blood. The Finnish DIPP and Norwegian MIDIA studies will together provide samples from 50 young prediabetic children who developed early islet autoimmunity, and from two controls matched to each case. The virome will be characterized by NGS from stool samples collected at five time points before islet autoimmunity. The obtained virus signatures will be tested by a highly multiplexed set of specific PCR assays in stool and also in corresponding blood samples. Statistical analysis will utilize mixed effects logistic regression models. The use of two distinct high-risk cohorts renders the study a unique robustness for detection of causative virus associations.

Kategorie VaV
AP - Aplikovaný výzkum
CEP - hlavní obor
EE - Mikrobiologie, virologie
CEP - vedlejší obor
FB - Endokrinologie, diabetologie, metabolismus, výživa
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>30202 - Endocrinology and metabolism (including diabetes, hormones)

Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Předložený projekt navazuje na předchozí činnost řešitele v oblasti hledání viru spouštějícího autoimunitu u nemocných s diabetem prvého typu. Projekt je řešen ve spolupráci s centry v Norsku a Finsku odkud pocházejí vzorky krve a stolice dětí s výraznou genetickou predispozicí k rozvoji diabetu, u části z nich se již diabetes vytvořil. Byl vyšetřeni střevní virom 163 sledovaných dětí a 329 kontrolních osob, stejně jako byly analyzovány virové signatury u 150 dětí s prediabetem a u adekvátních kontrolních osob. Diabetogenní virus se objevit nepodařilo, byly ale získány údaje týkající se lidského střevního mikrobiomu. Je dobré vyzvednout údaje týkající se zřejmě nejčastějšího střevního bakteriofága CrAssfág. Byly využity pokročilé metodiky molekulární genetiky i statistického zpracování. Výsledky je možno hodnotit jako vynikající, byly přijaty do 3 kvalitních impaktovaných časopisů, další články jsou rozpracovány.

Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP19-MZ0-NV-U/01:1
Datum dodání záznamu
28. 6. 2019

Podobné projekty(10)