Vývoj nového typovacího systému pro původce syfilis, Treponema pallidum subsp. pallidum, zaměřeného na proteomické rozdíly

Poskytovatel
Ministerstvo zdravotnictví
Program
Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2015 - 2023
Veřejná soutěž
Zdravotnický AV 3 (SMZ0201701)
Hlavní účastníci
Masarykova univerzita / Lékařská fakulta
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
17-31333A

Název projektu anglicky
Development of a new typing scheme for syphilis spirochete, Treponema pallidum subsp. pallidum, preferentially targeting proteome differences
Anotace anglicky
Treponema pallidum subsp. pallidum (TPA) is the causative agent of syphilis. More than 10 million of new syphilis cases are diagnosed annually. Two different typing systems were established for molecular characterization of TPA clinical isolates, however, their typing efficiency and discriminatory power was found to be highly variable. The aim of this project is to develop a new, highly effective molecular typing scheme preferentially targeting sequences encoding proteome differences, since they can be the cause of different clinical manifestation. The discrimination power of the new typing system will be assessed on genetically diverse clinical isolates and strains of different geographical origin. The knowledge of genetic differences of contemporary syphilis strains is essential due to continuing efforts of syphilis vaccine development. The new typing scheme will be applied on clinical samples from Czech Republic to obtain the information about variability and number of particular genotypes in the Czech Republic. Molecular data will be correlated with epidemiological data.

Kategorie VaV
AP - Aplikovaný výzkum
CEP - hlavní obor
FN - Epidemiologie, infekční nemoci a klinická imunologie
CEP - vedlejší obor
EE - Mikrobiologie, virologie
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>30302 - Epidemiology<br>30303 - Infectious Diseases

Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Cílem projektu bylo vytvoření nového molekulárně-genetického typovacího systému pro charakterizaci kmenů Treponema pallidum a jeho validace. Tento cíl byl splněn - byl vyvinut nový typovací MLST (Multi-Locus Sequence Typing) systém, který byl otestován na vzorcích z ČR, Švýcarska, Francie, Nizozemí, Argentiny a Kuby. Výsledky byly publikovány v 16 článcích, z toho 15 v časopisech s IF s kumulativním IF 53,43 v časopisech kvartilů Q1 (5), Q2 (7) a Q3 (3). Jedná se o vynikající projekt s celosvětovým přesahem.

Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP21-MZ0-NV-U/03:1
Datum dodání záznamu
25. 6. 2021

Podobné projekty(10)