Integrální analýza celogenomového sekvenování a mnohobarevné cytometrie - nástroj ke zlepšení diagnostiky a monitorování dětských akutních leukemií

Poskytovatel

Ministerstvo zdravotnictví

Program

Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2015 - 2023

Veřejná soutěž

Zdravotnický AV 4 (SMZ0201800001)

Hlavní účastníci

Univerzita Karlova / 2. lékařská fakulta

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

NV18-08-00385

Název projektu anglicky

Integrative analysis of high-throughput genomics and multiparameter flow cytometry to improve diagnosis and monitoring of childhood acute leukemia

Anotace anglicky

Acute lymphoblastic leukemia (ALL) is the most frequent cancer in children. Its improving outcome depends on accurate diagnosis and minimal residual disease (MRD) monitoring as done by flow cytometry. In proposed project we will develop automatic tools usable in clinical setting to analyse large numbers of multidimensional flow cytometry datasets. This will allow for clinical relevant categorisation of leukemias based on their immunophenotypes (LAIPs) with respect to outcome and other clinical features. Likewise better description of LAIPs dynamics and changes under treatment will allow for optimisation of MRD detection. Moreover, we will use whole genome data to associate genetic traits to immunophenotypes. Such integrative analysis will provide insights into relevance of genetic aberrations and their propagation into phenotype. Thus ultimately the combined analysis will lead to improvement of diagnostic of specific cancer subtypes and to better prediction of treatment outcome as well as rationalisation of costs of involved methods.

Kategorie VaV

AP - Aplikovaný výzkum

OECD FORD - hlavní obor

20602 - Medical laboratory technology (including laboratory samples analysis; diagnostic technologies) (Biomaterials to be 2.9 [physical characteristics of living material as related to medical implants, devices, sensors])

OECD FORD - vedlejší obor

30204 - Oncology

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory
(dle převodníku)

FD - Onkologie a hematologie
FS - Lékařská zařízení, přístroje a vybavení

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt umožnil vyvinutí automatické analýzy dat multiparametrické cytometrie v kontextu s transkriptomovou analýzou u akutní lymfoblastické leukémie a představuje tak velký přínos v oboru biomedicínských technologií. Navíc přináší informace ohledně počítačově asistované charakterizace rekonstituce hematopoezy. Pozitivní korelace imunofenotypovách a genomových dat u hodnocené kohorty ALL pacientů nebyla jednonačně pozorována, nicméně i tak projekt přináší řadu cenných poznatků a podkladů pro další výzkum. Získaná data byla publikována, případně jsou připravována k publikaci. Projekt lze považovat za velmi úspěšný, vytyčené cíle byly splněny.

Zahájení řešení

1. 5. 2018

Ukončení řešení

31. 12. 2021

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

6. 4. 2020

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP22-MZ0-NV-U

Datum dodání záznamu

30. 6. 2022

Celkové uznané náklady

7 624 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

7 624 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč