Komplexní prognostický a prediktivní panel pro pacienty s chronickou lymfocytární leukémií: nástroj sekvenování nové generace vhodný pro klinickou praxi i studium genetického pozadí průběhu choroby

Poskytovatel
Ministerstvo zdravotnictví
Program
Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2015 - 2023
Veřejná soutěž
Zdravotnický AV 5 (SMZ0201900001)
Hlavní účastníci
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
NV19-03-00091

Název projektu anglicky
Comprehensive prognostic and predictive panel for chronic lymphocytic leukemia: a next-generation sequencing tool suitable for clinical practice and study of genetic architecture behind the disease evolution
Anotace anglicky
Chronic lymphocytic leukemia (CLL) is common and still incurable leukemia of adults characterized by remarkable genetic and clinical heterogeneity. In the proposed project, we aim to study genetic background of clonal evolution in treatment naive CLL patients by tracking alteration dynamics in consecutive samples collected during the disease course. Our main objective is to early disclose the risk of disease progression and therapy need. We plan to assess both prognostic and predictive value of genomic aberrations detected before treatment administration. For this purpose, a highly complex next-generation sequencing (NGS) tool simultaneously analyzing both fundamental and novel CLL biomarkers will be implemented. We employ benefits of capture-based NGS technology enabling parallel analysis of IGHV mutational status, recurrent chromosomal and gene defects, and immunoglobulin light chains clonality. We presume that our NGS panel tailored for CLL can be widely adopted in clinical practice as a simple comprehensive test for better patient prognostication.

Kategorie VaV
AP - Aplikovaný výzkum
OECD FORD - hlavní obor
30204 - Oncology
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
FD - Onkologie a hematologie

Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Původní cíl projektu - vytvoření komplexního prognostického a prediktivního panelu pro pacienty s chronickou lymfocytární leukémií:byl rozšířen i na nejčastější typy non-hodgkinových lymfomů (DLBCL, FL, MCL, BL) a ALL. Byl vytvořen univerzální NGS panel s názvem LYNX (z angl. LYmphoid NeXt generation sequencing), který umožňuje analýzu mutací v 67 vybraných genech, chromozomových aberacích na úrovni celého genomu a analýzu nejčastějších translokací a přestaveb antigenních receptorů (IG a TR). NGS panel LYNX byl jako užitný vzor zapsán u Úřadu průmyslového vlastnictví a byl publikován s výhradní dedikací projektu. V souvislosti s tímto projektem vzniklo 8 Jimp - původních článků v recenzovaném odborném periodiku z databáze WoS s příznakem Article a 1 článek v recenzovaném odborném periodiku z databáze WoS s příznakem Review nebo Letter. Panel LYNX je v současnosti využíván kliniky na specializovaných pracovištích nejen v ČR, ale zájem byl projeven i ze zahraničí (USA, Singaour ...).

Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP23-MZ0-NV-U
Datum dodání záznamu
22. 6. 2023

Podobné projekty(10)