Klonální expanze u chronické lymfocytární leukémie – (epi)genomická charakterizace pro lepší pochopení nemoci

Poskytovatel

Ministerstvo zdravotnictví

Program

Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2024-2030

Veřejná soutěž

SMZ0202400001

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Lékařská fakulta

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

NW24-03-00052

Název projektu anglicky

Clonal expansions in chronic lymphocytic leukemia – (epi)genomic characterization towards better disease understanding

Anotace anglicky

In the present project, we would like to study the ontogenesis of chronic lymphocytic leukemia (CLL) through the systematic examination of its multiclonal form. CLL is typically a monoclonal disorder. However, in our previous work, we have described cases with multiclonal CLL in which several B-cell clones with unrelated immunoglobulin receptors expanded in a single patient. Such cases stand at the intersection between the premalignant phase and overt CLL, and represent a unique model for exploring CLL evolution. Our previous findings show that coexisting clones significantly more often carry concordant somatic hypermutation status of immunoglobulin variable gene IGHV that could reflect specific B-cell maturation stages when the malignant transformation occurred. We will apply single-cell transcriptome sequencing and chromatin accessibility analysis to reveal the molecular profiles of these stages. We will assess whether these stages are common or different for individual coexisting clones. Further, published data propose that abnormalities initiating CLL may appear already in hematopoietic progenitors. For this, we will apply whole-exome sequencing to identify mutations shared by coexisting clones, potentially influencing their proliferation in the initial stages of development, and assess their functional impacts. In addition, we will use detected somatic variants for constructing clonal architecture and phylogenetic trees describing the development of individual clones.

Kategorie VaV

AP - Aplikovaný výzkum

OECD FORD - hlavní obor

30204 - Oncology

OECD FORD - vedlejší obor

30205 - Hematology

OECD FORD - další vedlejší obor

30403 - Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions [pharmacogenomics, gene-based therapeutics])

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

EI - Biotechnologie a bionika<br>FD - Onkologie a hematologie

Zahájení řešení

1. 5. 2024

Ukončení řešení

31. 12. 2027

Poslední stav řešení

Z - Začínající víceletý projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP24-MZ0-NW-R

Datum dodání záznamu

25. 3. 2024

Celkové uznané náklady

15 461 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

15 461 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč