Vývoj modulární bioinformatické platformy pro analýzu dat získaných sekvenováním nové generace

Název projektu anglicky
Development of modular bioinformatics platform for next-generation sequencing data analysis.
Anotace anglicky
The main goals of proposed project are (i) establishing a comprehensive capture-based NGS panel for haematological malignancies and (ii) the consequent creation of a versatile bioinformatic tool that enables simultaneous analysis of several genetic alterations and is applicable for regular users in research and diagnostic routine. Users will be able to simply run analytic pipeline with preset parameters with option to customize their own project scenarios. Final results will be stored and presented in interactive visualizations ready to export. The platform will be primarily designed for the currently arising haemato-oncological panel, nevertheless our aim is to create a highly modular bioinformatics platform potentially transferable to other targeted applications.

Kategorie VaV
VV - Experimentální vývoj
OECD FORD - hlavní obor
10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
OECD FORD - vedlejší obor
30204 - Oncology
OECD FORD - další vedlejší obor
30205 - Hematology
CEP - odpovídající obory (dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
AF - Dokumentace, knihovnictví, práce s informacemi BC - Teorie a systémy řízení BD - Teorie informace FD - Onkologie a hematologie IN - Informatika

Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Cíle projektu byly splněny podle zadání v plánovaném čase. V průběhu řešení projektu došlo také k dosažení výsledků nad rámec původních předpokladů v podobě prezentování výsledků v odborném časopise s IF. Publikační úspěch tak napovídá o zajímavosti protokolu LYNX pro celosvětové vědecké publikum a kvalitě výsledků, které poskytuje. Využití finančních prostředků bylo jasně dokladováno a přidělené prostředky byly použity účelně. Implementační plán zahrnuje další využití výsledků projektu. Celkově byl tedy projekt vypracován na vysoké odborné úrovni.

Důvěrnost údajů
C - Předmět řešení projektu podléhá obchodnímu tajemství (§ 504 Občanského zákoníku), ale název projektu, cíle projektu a u ukončeného nebo zastaveného projektu zhodnocení výsledku řešení projektu (údaje P03, P04, P15, P19, P29, PN8) dodané do CEP, jsou upraveny tak, aby byly zveřejnitelné.
Systémové označení dodávky dat
CEP22-TA0-TJ-U
Datum dodání záznamu
30. 6. 2022

Podobné projekty(10)