Využití DNA markerů pro kontrolu deklarovaného původu reprodukčního materiálu smrku ztepilého

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00020702%3A_____%2F21%3AN0000019" target="_blank" >RIV/00020702:_____/21:N0000019 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://www.vulhm.cz/files/uploads/2021/12/647b.pdf" target="_blank" >https://www.vulhm.cz/files/uploads/2021/12/647b.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Využití DNA markerů pro kontrolu deklarovaného původu reprodukčního materiálu smrku ztepilého

Popis výsledku v původním jazyce

Genetickou skladbu organismů a jejich variabilitu na úrovni populací a jedinců lze stanovit pomocí DNA markerů, které jsou založeny na polymorfismu nukleotidových sekvencí a na rozdíl od izoenzymových markerů nereagují na environmentální změny. Pro získání informací o genetické proměnlivosti studovaných jedinců je nutné vyhledat vysoce polymorfní DNA markery, např. mikrosatelitové (SSR) markery. Mikrosatelity byly poprvé popsány a využity v humánní medicíně, jejich využití se dále rozšířilo i pro studium dalších organismů a v současnosti metoda SSR markerů patří mezi standardní molekulárně genetické techniky. Vzhledem ke kodominantnímu charakteru v kombinaci s velkým počtem variabilních alel se SSR markery dají využít pro identifikaci klonů a kultivarů rostlin a také pro mapování genomů. Mikrosatelitové markery jsou vhodné i pro rozlišení druhů a hybridů u lesních dřevin, vykazují vysokou úroveň diverzity a jsou vhodné pro populační genetické studie. Cílem práce bylo na základě analýz DNA s využitím vybraných mikrosatelitových markerů ověřit úroveň genetické rozmanitosti, heterozygotnosti a dalších genetických charakteristik u vybraných vzorků RM smrku ztepilého, zjistit genetickou strukturu a podobnost sledovaných oddílů RM a ověřit vhodnost metodiky pro sledování identity RM u smrku ztepilého.

Název v anglickém jazyce

Use of DNA analyzes for verifying the declared origin of Norway spruce reproductive material

Popis výsledku anglicky

The purpose of this study was to investigate the possibilities of using objective methods of DNA analysis to verify the declared origin of reproductive material of Norway spruce in terms of the Czech Republic. Monitoring of the identity of reproductive material was carried out during three years, i.e., from seed collection to transplanted plants production. Reference samples from the 32 sets of reproductive material were obtained, analyses of microsatellite markers were performed, and the genetic compositions of sets were compared after statistical processing. Altogether, DNA analyses were performed on 1920 samples of plant material from 8 selected sources of forest reproductive material (units of forest reproductive material). Seven optimally polymorphic markers with sufficient informative value were selected for the subsequent evaluation of the genetic structure of the monitored sets of Norway spruce reproductive material by Bayesian clustering. Using the performed Structure analysis, the obtained profiles of 8 monitored units of reproductive material (4 sample sets from one units) of different origin were distinguishable from each other. Thus, these methodological procedures could be used in the state control systems to certify the origin of forest reproductive material and increase consumer protection of forest owners and nursery production in the Czech Republic.

Druh

J_SC - Článek v periodiku v databázi SCOPUS

CEP obor

—

OECD FORD obor

40102 - Forestry

Projekt

<a href="/cs/project/QK1810129" target="_blank" >QK1810129: Navržení metodických postupů pro zavedení systému kontroly deklarovaného původu reprodukčního materiálu vybraných lesnicky významných druhů dřevin použitého pro umělou obnovu lesa pomocí analýz DNA v podmínkách ČR</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2021

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Zprávy lesnického výzkumu

ISSN

0322-9688

e-ISSN

1805-9872

Svazek periodika

66

Číslo periodika v rámci svazku

4

Stát vydavatele periodika

CZ - Česká republika

Počet stran výsledku

10

Strana od-do

292-301

Kód UT WoS článku

000753362000007

EID výsledku v databázi Scopus

2-s2.0-85125387761