Metodické postupy klonové identifikace a stanovení genetické diverzity dubu červeného (Quercus rubra L.) na základě analýz mikrosatelitových markerů

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00020702%3A_____%2F24%3AN0000080" target="_blank" >RIV/00020702:_____/24:N0000080 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://www.vulhm.cz/files/uploads/2025/03/LP_4_2024.pdf" target="_blank" >https://www.vulhm.cz/files/uploads/2025/03/LP_4_2024.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Metodické postupy klonové identifikace a stanovení genetické diverzity dubu červeného (Quercus rubra L.) na základě analýz mikrosatelitových markerů

Popis výsledku v původním jazyce

Cílem metodiky je představit postupy DNA analýz s využitím polymorfních mikrosatelitových markerů pro sledování úrovně genetické diverzity a zjišťování klonové identity u dubu červeného jako potenciálně hospodářsky využitelné dřeviny vzhledem ke schopnosti zdárně odrůstat v měnících se podmínkách prostředí. Pomocí představených postupů DNA analýz lze u rostoucích porostů dubu červeného ověřovat hodnoty genetické diverzity a vybírat variabilní zdroje reprodukčního materiálu pro zvýšení adaptačního potenciálu této dřeviny.

Název v anglickém jazyce

Methodological procedures for clonal identification and determination of genetic diversity of red oak (Quercus rubra L.) based on analyzes of microsatellite markers

Popis výsledku anglicky

The aim of this methodology is to present the use of DNA analyses by nuclear microsatellite markers for monitoring the genetic variability and for determination of the clonal identity in species red oak. The red oak (Quercus rubra L.) is a tree native to the eastern and central parts of the USA. In the Czech Republic, it is used in forestry from the lowlands to the hills, as one of the most common introduced trees, which grows faster than czech native oaks in favourable habitats and gives good yields. It is also introduced into forest stands on poor, acidic and degraded soils as a soil protection and melioration tree. The methodology describes the processes of sampling, isolation of DNA, conditions of the polymerase chain reaction (PCR), separation and sizing of amplification products, and molecular data calculations. The selected trees of red oak from 4 localities were used to develop this methodology. Fifteen selected polymorphic nuclear microsatellite markers proved suitable for finding the genetic parameters for verifying the levels of genetic diversity between different red oak genotypes, and they can be used to determine the clonal identity. Although this species is considered invasive, it is more resistant to climate change and grows better than native oaks and could therefore be used as a replacement tree for wood production. Using the presented methodology of DNA analysis, it will be possible to verify the genetic parameters of phenotypically high-quality individuals and to select suitable clones ensuring sufficient diversity for the establishment of propagation stands, for potentially economically use this trees species in changing environmental conditions.

Druh

N_metC - Metodiky certifikované oprávněným orgánem

CEP obor

—

OECD FORD obor

40102 - Forestry

Projekt

<a href="/cs/project/QK22020045" target="_blank" >QK22020045: Potenciál geograficky nepůvodních druhů dřevin v lesním hospodářství ČR</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2024

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

CM-8/2024

Číslo předpisu

MZE-87360/2024-16222/M289

Technické parametry

Smlouva o uplatnění metodiky č. CM-8/2024 byla uzavřena 29. 11. 2024 se společností Lesnická a agro - dřevařská, a. s., se sídlem Slavojova 57919, 128 00 Praha 2 – Nusle. IČ: 06197221; Zastoupená předsedou správní rady lng. Stanislavem Miltnerem, DiS., Ph,D., tel.: 604714264; e-mail: agro-drevarska.as@seznam.cz

Ekonomické parametry

Předpokládané přínosy jsou pro uživatele metodiky ve finanční úspoře vynaložených prostředků na vývoj metodických postupů DNA analýz s využitím mikrosatelitových markerů pro stanovení genetické diverzity u potenciálních zdrojů reprodukčního materiálu (RM) dubu červeného. Popsané metodické postupy se uplatní při zajištění kvalitních genetických zdrojů reprodukčního materiálu dubu červeného s dostatečnou variabilitou pro případné širší uplatnění v lesním hospodářství, kde vedle vyšších produkčních schopností se tento druh uplatní i jako meliorační a zpevňující dřevina. Lze předpokládat zvýšený ekonomický přínos z těžby dřeva u porostů založených z kvalitních zdrojů RM. Na základě provedených kalkulací je možné přijmout závěr, že na stejné ploše lesního pozemku je možné při pěstování dubu červeného oproti dubu zimnímu dosáhnout ve 100 letech výrazně vyššího ekonomického výsledku (vyšších tržeb z prodeje dříví, cca 460 000–560 000 Kč), celkový čistý výnos by se pak pohyboval v rozmezí cca 340 000–440 000 Kč.

Označení certifikačního orgánu

Ministerstvo zemědělství, Těšnov 17, Praha 1

Datum certifikace

—

Způsoby využití výsledku

C - Výsledek je využíván bez omezení okruhu uživatelů