Langerhans islet volume estimation from 3D optical projection tomography

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00023001%3A_____%2F17%3A00076329" target="_blank" >RIV/00023001:_____/17:00076329 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://link.springer.com/book/10.1007/978-3-319-54427-4?page=3#toc" target="_blank" >https://link.springer.com/book/10.1007/978-3-319-54427-4?page=3#toc</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1007/978-3-319-54427-4_42" target="_blank" >10.1007/978-3-319-54427-4_42</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Langerhans islet volume estimation from 3D optical projection tomography

Popis výsledku v původním jazyce

This paper concerns the comparison of automatic volume estimation methods for isolated pancreatic islets. The estimated islet volumes are needed during the process of assessing the islet sample quality prior to the islet transplantation. We study several different methods for automatic volume estimation. For this purpose we acquired a set of projections using optical tomography for a sample of an islet population. Based on these projections we estimated the islet volumes using two stereological methods (the automatic Wulfsohn’s method and the manual fakir method, considered to be the ground truth in this study), together with the filtered back projection followed by 3D segmentation. We have also employed two simple methods, currently used in medical practice, based on fitting a sphere or a prolate ellipsoid to a single binarized 2D islet projections.

Název v anglickém jazyce

Langerhans islet volume estimation from 3D optical projection tomography

Popis výsledku anglicky

This paper concerns the comparison of automatic volume estimation methods for isolated pancreatic islets. The estimated islet volumes are needed during the process of assessing the islet sample quality prior to the islet transplantation. We study several different methods for automatic volume estimation. For this purpose we acquired a set of projections using optical tomography for a sample of an islet population. Based on these projections we estimated the islet volumes using two stereological methods (the automatic Wulfsohn’s method and the manual fakir method, considered to be the ground truth in this study), together with the filtered back projection followed by 3D segmentation. We have also employed two simple methods, currently used in medical practice, based on fitting a sphere or a prolate ellipsoid to a single binarized 2D islet projections.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

—

OECD FORD obor

30224 - Radiology, nuclear medicine and medical imaging

Projekt

<a href="/cs/project/GA14-10440S" target="_blank" >GA14-10440S: Automatická analýza mikroskopických snímků Langerhansových ostrůvků</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2017

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

Computer Vision – ACCV 2016 Workshops. Part II

ISBN

978-3-319-54427-4

ISSN

0302-9743

e-ISSN

1611-3349

Počet stran výsledku

12

Strana od-do

583-594

Název nakladatele

Springer

Místo vydání

Cham

Místo konání akce

Taipei, TW

Datum konání akce

20. 11. 2016

Typ akce podle státní příslušnosti

WRD - Celosvětová akce

Kód UT WoS článku

000426193700042