Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Knowledge-based subtractive integration of mRNA and miRNA expression profiles to differentiate myelodysplastic syndrome

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00023736%3A_____%2F14%3A00011257" target="_blank" >RIV/00023736:_____/14:00011257 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/68407700:21230/14:00214309

  • Výsledek na webu

    <a href="http://www.bioinformatics.biostec.org/Abstracts/2014/BIOINFORMATICS_2014_Abstracts.htm#Area0FullPapers" target="_blank" >http://www.bioinformatics.biostec.org/Abstracts/2014/BIOINFORMATICS_2014_Abstracts.htm#Area0FullPapers</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Knowledge-based subtractive integration of mRNA and miRNA expression profiles to differentiate myelodysplastic syndrome

  • Popis výsledku v původním jazyce

    The goal of our work is to integrate conventional mRNA expression profiles with miRNA expressions using the knowledge of their validated or predicted interactions in order to improve class prediction in genetically conditioned diseases. The raw mRNA andmiRNA expression features get enriched or replaced by new aggregated features that model the mRNA-miRNA regulation. The proposed subtractive integration method is directly motivated by the inhibition/degradation models of gene expression regulation. Themethod aggregates mRNA and miRNA expressions by subtracting a proportion of miRNA expression values from their respective target mRNAs. The method is used to model the outcome or progress of myelodysplastic syndrome, a blood production disease often progressing to leukemia. The reached results demonstrate that the integration improves classification accuracy when dealing with mRNA and miRNA profiles of comparable predictive power

  • Název v anglickém jazyce

    Knowledge-based subtractive integration of mRNA and miRNA expression profiles to differentiate myelodysplastic syndrome

  • Popis výsledku anglicky

    The goal of our work is to integrate conventional mRNA expression profiles with miRNA expressions using the knowledge of their validated or predicted interactions in order to improve class prediction in genetically conditioned diseases. The raw mRNA andmiRNA expression features get enriched or replaced by new aggregated features that model the mRNA-miRNA regulation. The proposed subtractive integration method is directly motivated by the inhibition/degradation models of gene expression regulation. Themethod aggregates mRNA and miRNA expressions by subtracting a proportion of miRNA expression values from their respective target mRNAs. The method is used to model the outcome or progress of myelodysplastic syndrome, a blood production disease often progressing to leukemia. The reached results demonstrate that the integration improves classification accuracy when dealing with mRNA and miRNA profiles of comparable predictive power

Klasifikace

  • Druh

    D - Stať ve sborníku

  • CEP obor

    FD - Onkologie a hematologie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2014

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název statě ve sborníku

    BIOINFORMATICS 2014: proceedings of the international conference on bioinformatics models, methods and algorithms

  • ISBN

    978-989-758-012-3

  • ISSN

  • e-ISSN

  • Počet stran výsledku

    9

  • Strana od-do

    31-39

  • Název nakladatele

    SciTePress

  • Místo vydání

    Setubal

  • Místo konání akce

    Angers, Loire Valley, France

  • Datum konání akce

    3. 3. 2014

  • Typ akce podle státní příslušnosti

    WRD - Celosvětová akce

  • Kód UT WoS článku

    000345686400009