Identifikace Neofabraea alba pomocí polymerázové řetězové reakce
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027006%3A_____%2F08%3A00000047" target="_blank" >RIV/00027006:_____/08:00000047 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
Identifikace Neofabraea alba pomocí polymerázové řetězové reakce
Popis výsledku v původním jazyce
Kruhová hnědá hniloba jablek a hrušek, kterou způsobuje Neofabraea alba, je v Evropě významnou skládkovou chorobou. Sekvence genů pro ribozomální RNA pěti patogenních druhů rodu Neofabraea jsou v téměř identické, jen ve vnitřních přepisovaných mezernících (ITS1 a ITS2) byly zjištěny malé rozdíly. V ITS1 byl objeven shluk tří nehomologních nukleotidů a v ITS2 shluk dvou nehomologních nukletidů. Tyto rozdíly byly využity při navrhování primerů, které následně umožnily specifickou amplifikaci vybrané sekvence DNA polymerázovou řetězovou reakcí (PCR). Dosažené výsledky ukazují úspěšné využití mezerníků ITS1 a ITS2 pro odlišení blízce příbuzných druhů.
Název v anglickém jazyce
Identification of Neofabraea alba using PCR
Popis výsledku anglicky
Neofabraea alba is the pathogen causing bull's eye rot of apple and pear in Europe which is an important postharvest disease. The ribosomal genes from five pathogenic species of the genus Neofabraea are essentially identical, but small differences were identified in the internal transcribed spacers (ITS! and ITS2) of the five species. A cluster of three non-homologous nucleotides was observed in ITS! and a cluster of two in ITS2. These differences permitted the synthesis of nucleotides that allowed foran efficient, fungus-specific amplification of either DNA sequence by polymerase chain reaction (PCR) The results illustrate the effective use of intcrgenic sequences for the differentiation of close related species.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
GF - Choroby, škůdci, plevely a ochrana rostlin
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/QG60123" target="_blank" >QG60123: Výzkum a inovace postupů diagnostiky hospodářsky významných, regulovaných a karanténních fytopatogenních organismů pro systém certifikace ovocných dřevin s důrazem na molekulární metody</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2008
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Mykologické listy
ISSN
1213-5887
e-ISSN
—
Svazek periodika
105
Číslo periodika v rámci svazku
105
Stát vydavatele periodika
CZ - Česká republika
Počet stran výsledku
7
Strana od-do
—
Kód UT WoS článku
—
EID výsledku v databázi Scopus
—