Analýza nrDNA polymorfismu u blízce příbuzných diploidních sexuálních, tetraploiních sexuálních a polyploidních agamospermických druhů
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F67985939%3A_____%2F09%3A00323148" target="_blank" >RIV/67985939:_____/09:00323148 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/68378050:_____/09:00323148
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Analysis of nrDNA polymorphism in closely related diploid sexual, tetraploid sexual and polyploid agamospermous species
Popis výsledku v původním jazyce
Nuclear sequences of ITS1-5.8S-ITS2 region of rDNA may be an important source of phylogenetically informative data provided that nrDNA is cloned and the character of sequence variation of clones is properly analysed. nrDNA of selected Taraxacum sectionswas studied to show sequence variation differences among diploid sexual, tetraploid sexual and polyploidy agamospermous species. We examined nucleotide characteristics, substitution pattern, secondary structure, and the phylogenetic utility of ITS1-5.8S-ITS2 from 301 clones of 32 species representing 11 sections. The most divergent sequences of ITS1 and 2 differed by 17.1 % and in 5.8S only by 3.7 %. The ITS1-5.8S-ITS2 characteristics, integrity and also stability of secondary structures confirmed thatpseudogenes are not responsible for the above variation. The within-individual polymorphism of clones implies that the concerted evolution of ITS cistron of agamospermous polyploid Taraxacum is remarkably suppressed.
Název v anglickém jazyce
Analysis of nrDNA polymorphism in closely related diploid sexual, tetraploid sexual and polyploid agamospermous species
Popis výsledku anglicky
Nuclear sequences of ITS1-5.8S-ITS2 region of rDNA may be an important source of phylogenetically informative data provided that nrDNA is cloned and the character of sequence variation of clones is properly analysed. nrDNA of selected Taraxacum sectionswas studied to show sequence variation differences among diploid sexual, tetraploid sexual and polyploidy agamospermous species. We examined nucleotide characteristics, substitution pattern, secondary structure, and the phylogenetic utility of ITS1-5.8S-ITS2 from 301 clones of 32 species representing 11 sections. The most divergent sequences of ITS1 and 2 differed by 17.1 % and in 5.8S only by 3.7 %. The ITS1-5.8S-ITS2 characteristics, integrity and also stability of secondary structures confirmed thatpseudogenes are not responsible for the above variation. The within-individual polymorphism of clones implies that the concerted evolution of ITS cistron of agamospermous polyploid Taraxacum is remarkably suppressed.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EF - Botanika
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2009
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Plant Systematics and Evolution
ISSN
0378-2697
e-ISSN
—
Svazek periodika
278
Číslo periodika v rámci svazku
1-2
Stát vydavatele periodika
AT - Rakouská republika
Počet stran výsledku
19
Strana od-do
—
Kód UT WoS článku
000263674500006
EID výsledku v databázi Scopus
—