Metoda dvourozměrné diferenční gelové elektroforézy (2-D DIGE) a její využití v proteomice

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027006%3A_____%2F10%3A00001157" target="_blank" >RIV/00027006:_____/10:00001157 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Metoda dvourozměrné diferenční gelové elektroforézy (2-D DIGE) a její využití v proteomice

Popis výsledku v původním jazyce

Příspěvek se zabývá popisem metody dvourozměrné diferenční gelové elektroforézy (2D-DIGE) a možnostmi jejího využití v proteomice. Důraz je kladen zvláště na ty aspekty metody 2D-DIGE, které se odlišují od "klasické" dvourozměrné denaturační elektroforézy (2D SDS-PAGE), tj. značení proteinových vzorků fluorescenčními barvivy CyDyes, dělení vzorků a detekce jednotlivých proteinových skvrn (spotů). V závěru jsou stručně shrnuty hlavní výhody a nevýhody metody 2D-DIGE (možnost současného rozdělení dvou různých vzorků v jednom gelu včetně interního standardu - alespoň částečná eliminace potíží s reproducibilitou gelů; vyšší pořizovací náklady na fluorescenční scanner pro detekci proteinů označených barvivy CyDyes; v případě tzv. minimálního barvení nemožnost detekovat proteiny, které neobsahují lysin; v případě tzv. saturačního barvení nemožnost detekovat proteiny, které neobsahují cystein).

Název v anglickém jazyce

The method of tvo-dimensional differential gel electrophoresis and its application in proteomics

Popis výsledku anglicky

The manuscript deals with the method of two-dimensional differential gel electrophoresis (2D-DIGE) and its application in proteomics. First, the method of 2D-DIGE is characterised and compared to "classical" denaturating 2-DE, especially 2D SDS-PAGE. Themain focus is given on protein sample preparation, especially sample labelling with CyDyes fluorescent dyes. In addition, protein separation and subsequent detection of labelled protein is described. In conclusion, the main advatages (separation of twodifferent protein samples plus an internal standard in one gel - reduction of inter-gel variability, avoiding problems with gel reproducibility) and disadvatages (higher costs on 2D-DIGE gels - costs on sample labelling with CyDyes, costs on fluorescentscanner for detection of protein spots labelled with CyDyes; minimal labelling - inability to detect proteins without lysine residues; saturation labelling - inability to detect proteins without cysteine residues) are discussed.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

CE - Biochemie

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2010

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Chemické listy

ISSN

0009-2770

e-ISSN

—

Svazek periodika

104

Číslo periodika v rámci svazku

7

Stát vydavatele periodika

CZ - Česká republika

Počet stran výsledku

6

Strana od-do

—

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—