Identification of suitable reference gene for quantitative transcription analysis (RT-qPCR) of Fusarium culmorum genes in infected barley plants

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027006%3A_____%2F18%3A00004433" target="_blank" >RIV/00027006:_____/18:00004433 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/25328859:_____/18:N0000005

Výsledek na webu

<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.jcs.2017.12.004" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1016/j.jcs.2017.12.004</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.jcs.2017.12.004" target="_blank" >10.1016/j.jcs.2017.12.004</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Identification of suitable reference gene for quantitative transcription analysis (RT-qPCR) of Fusarium culmorum genes in infected barley plants

Popis výsledku v původním jazyce

Based on the RTqPCR aynalysis of reference genes transcription in infected barley in greenhouse and field conditions, and during the malting, we have confirmed that ubiquitin (UBC) is a suitable reference gene for normalization transcription of Fusarium culmorum genes in barley infected with the pathogen. We found a positive correlation between the transcription of the three genes and the growth of F. culmorum DNA in the affected tissues. Since the selection of a suitable reference gene is essential for measuring transcription and is to be verified not only for different parts of plants and related species, we also recommend testing whether this RG has the ability to reflect changes in the pathogen content of the infected plant tissue.

Název v anglickém jazyce

Identification of suitable reference gene for quantitative transcription analysis (RT-qPCR) of Fusarium culmorum genes in infected barley plants

Popis výsledku anglicky

Based on the RTqPCR aynalysis of reference genes transcription in infected barley in greenhouse and field conditions, and during the malting, we have confirmed that ubiquitin (UBC) is a suitable reference gene for normalization transcription of Fusarium culmorum genes in barley infected with the pathogen. We found a positive correlation between the transcription of the three genes and the growth of F. culmorum DNA in the affected tissues. Since the selection of a suitable reference gene is essential for measuring transcription and is to be verified not only for different parts of plants and related species, we also recommend testing whether this RG has the ability to reflect changes in the pathogen content of the infected plant tissue.

Druh

J_imp - Článek v periodiku v databázi Web of Science

CEP obor

—

OECD FORD obor

40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)

Projekt

<a href="/cs/project/QI111B044" target="_blank" >QI111B044: Komplexní strategie pro minimalizaci negativního dopadu infekce toxikogenními houbami r. Fusarium v obilovinách a odvozených produktech.</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2018

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Journal of Cereal Science

ISSN

0733-5210

e-ISSN

1095-9963

Svazek periodika

79

Číslo periodika v rámci svazku

JAN 2018

Stát vydavatele periodika

GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

Počet stran výsledku

6

Strana od-do

418-423

Kód UT WoS článku

000426412700059

EID výsledku v databázi Scopus

2-s2.0-85038224279