Detekce půdou přenosných patogenů rostlin pomocí mobilního real-time PCR systému
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027006%3A_____%2F18%3A00004683" target="_blank" >RIV/00027006:_____/18:00004683 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
Detekce půdou přenosných patogenů rostlin pomocí mobilního real-time PCR systému
Popis výsledku v původním jazyce
Vědci Washington State University v USA vyvinuli mobilní diagnostickou metodu používající přenosný přístroj pro real-time PCR (polymerázová řetězová reakce v reálném čase). Technologie real-time PCR nabízí výhody oproti jiným metodám z hlediska přesnosti kvantifikace, citlivosti a univerzálnosti, a je široce využívána pro detekci dlouhé řady rostlinných patogenů v půdě, včetně různých patogenů brambor. Vzhledem k současnému trendu rychle rostoucího kompetitivního trhu pokračuje vývoj kompaktnějšího a lacinějšího zařízení potřebného pro technologii PCR. Protokol obsahuje následující kroky: extrakci nukleových kyselin magnetickými kuličkami, přenosný real-time PCR protokol (založený na fluorescenční sondě) a analýzu kvantitativních dat, která může být celá udělána na dálku pomocí přenosného počítače.
Název v anglickém jazyce
Detection of Soil-Borne Phytopathogens Using a Portable Real-Time PCR System
Popis výsledku anglicky
On-site diagnosis of plant diseases can be a useful tool for growers for timely decisions enabling the earlier implementation of disease management strategies that reduce the impact of the disease. Presently in many diagnostic laboratories, the polymerase chain reaction (PCR), particularly real-time PCR, is considered the most sensitive and accurate method for plant pathogen detection. However, laboratory-based PCRs typically require expensive laboratory equipment and skilled personnel. In this study, soil-borne pathogens of potato are used to demonstrate the potential for on-site molecular detection. This was achieved using a rapid and simple protocol comprising of magnetic bead-based nucleic acid extraction, portable real-time PCR (fluorogenic probe-based assay). The portable real-time PCR approach compared favorably with a laboratorybased system, detecting as few as 100 copies of DNA from Spongospora subterranea. The portable real-time PCR method developed here can serve as an alternative to laboratory-based approaches and a useful on-site tool for pathogen diagnosis.
Klasifikace
Druh
O - Ostatní výsledky
CEP obor
—
OECD FORD obor
40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2018
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů