Reakční směs pro diagnostiku délkového polymorfismu bi-funkčního genu STORR máku setého (Papaver somniferrum L.)

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027006%3A_____%2F19%3A00005659" target="_blank" >RIV/00027006:_____/19:00005659 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://isdv.upv.cz/doc/FullFiles/UtilityModels/FullDocuments/FDUM0033/uv033425.pdf" target="_blank" >https://isdv.upv.cz/doc/FullFiles/UtilityModels/FullDocuments/FDUM0033/uv033425.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Reakční směs pro diagnostiku délkového polymorfismu bi-funkčního genu STORR máku setého (Papaver somniferrum L.)

Popis výsledku v původním jazyce

Technické řešení umožňuje stanovení sekvenční odlišnosti bifunkčního genu STORR máku setého (Papaver somniferum L.). Gen kóduje protein s dvěma funkcemi. Je zapojený do biosyntézy benzylizochinolinových alkaloidů morfinového typu. Je nezbytný pro izomeraci (S) - (R) -retirulinu. Část I - modul - cytochromu P450 je zodpovědná za konverzi (S) -retikulinu na 1,2-dehydroretulin, zatímco část II - modul s oxidoreduktázovou aktivitou konvertuje 1,2-dehydroretikulin na (R) -retikulin. Na pracovišti, byl tento gen klonován a sekvenován a byla získána sekvence genu STORR z odrůd máků (P. somniferum L.), které jsou v ČR povolené pro pěstování pro potravinářské využití, a dalších odpovídajících sekvencí DNA máků z genetických zdrojů a DNA z vysokoobsahových typů. Na základě sekvenční variability genomických úseků uvedeného genu STORR jsme identifikovali délkový polymorfismus oblast prvního intronu genu STORR Pro detekci tohoto polymorfismu jsme navrhli a verifikovali použití páru PCR primerů, který umožňuje amplifikaci cílových úseků DNA (dále amplikonů). Na pracovišti předkladatele byla vyvinuta a verifikována reakční sada, která umožňuje identifikovat amplikony z odlišných genotypů máku. Reakční sada zahrnuje specifické primery pro amplifikaci části sekvence genu pro gen STORR máku setého pomocí PCR. Po provedení reakce je přítomnost amplikonu genu STORR odlišných délek, identifikována separací produktů v kapilární elektroforéze. Výsledky jsou využívány k odlišení nositelů odlišných alel genu STORR.

Název v anglickém jazyce

Reaction mixture for diagnosis of the longitudinal polymorphism of the bi-functional STORR poppy gene (Papaver somniferrum L.)

Popis výsledku anglicky

The technical approach enables to determine the sequence difference of the bifunctional gene STORR of poppy (Papaver somniferum L.). The gene encodes a protein with two functions. It is involved in the biosynthesis of benzylisoquinoline alkaloids of the morphine type. It is necessary for the isomerization of (S) - (R) -retirulin. Part I - the module - cytochrome P450 is responsible for the conversion of (S) -reticulin to 1,2-dehydroretulin, while Part II - the module with oxidoreductase activity converts 1,2-dehydroreticulin to (R) -reticulin. In the workplace, this gene was cloned and sequenced  and we obtained the STORR gene sequences from poppy varieties (P. somniferum L.), which are allowed in the Czech Republic for cultivation for food use, and other corresponding DNA populations from genetic sources and DNA from high-content types. Based on the sequence variability of the genomic regions of the STORR gene, we identified the length polymorphism of the region of the first intron of the STORR gene. A reaction kit has been developed and verified at the presenter's site to identify amplicons from different poppy genotypes. The reaction set includes specific primers for amplifying part of the gene sequence for the STORR gene of poppy seed by PCR. Following the reaction, the presence of the STORR gene amplicon of different lengths is identified by product separation in capillary electrophoresis. The results are used to distinguish carriers of different alleles of the STORR gene.

Druh

F_uzit - Užitný vzor

CEP obor

—

OECD FORD obor

40401 - Agricultural biotechnology and food biotechnology

Projekt

<a href="/cs/project/QK1720263" target="_blank" >QK1720263: Diagnostické metody pro laboratorní kontrolu pravosti máku setého</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2019

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Číslo patentu nebo vzoru

33425

Vydavatel

CZ001 -

Název vydavatele

Industrial Property Office

Místo vydání

Prague

Stát vydání

CZ - Česká republika

Datum přijetí

—

Název vlastníka

Výzkumný ústav rostlinné výroby, v.v.i.

Způsob využití

A - Výsledek využívá pouze poskytovatel

Druh možnosti využití

N - Využití výsledku jiným subjektem je možné bez nabytí licence (výsledek není licencován)