Studie diferenciální genové exprese u ovcí infikovaných bakterií Corynebacterium pseudotuberculosis

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027014%3A_____%2F21%3AN0000034" target="_blank" >RIV/00027014:_____/21:N0000034 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://vuzv.cz/_privat/21032.pdf" target="_blank" >https://vuzv.cz/_privat/21032.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Studie diferenciální genové exprese u ovcí infikovaných bakterií Corynebacterium pseudotuberculosis

Popis výsledku v původním jazyce

Corynebacterium pseudotuberculosis (C. pseudotuberculosis) je bakteriální původce chronického onemocnění kaseózní lymfadenitida, které způsobuje v chovech malých přežvýkavců značné ekonomické ztráty. Cílem této studie bylo získat detailní informace o patogenezi onemocnění a imunitní odpovědi hostitele u nakažených ovcí analýzou globální genové exprese metodou vysokokapacitního sekvenování. Bylo detekováno průměrně 26 796 transkriptů, to představuje 63% ze všech známých transkriptů ovce. Z přibližně 32 mil. analyzovaných sekvencí bylo 55 – 58 % readů jednoznačně namapováno na referenční genom ovce. Odolné bahnice ze zasaženého chovu měly celkem 245 diferenciálně exprimovaných genů (DEG) oproti kontrolním, zdravým samicím. U nemocných bahnic bylo vyhodnoceno celkem 195 DEG. Nákaza Cps byla příčinou zvýšené regulace 57 biologických procesů, především buněčného cyklu, mitózy, meioze, segregace chromozómů a organel, včetně kontroly těchto procesů. Diferenciálně exprimované geny byly klasifikovány do 54 různých metabolických a signálních biochemických drah, které byly ovlivněny nákazou bakterií Cps a onemocněním CLA. Celkem 21 zapojených signálních drah je možno považovat za součást řízení imunitní odezvy a udržení homeostáze zdravého organismu.

Název v anglickém jazyce

Differential gene expression associated with Corynebacterium pseudotuberculosis infection in sheep

Popis výsledku anglicky

Caseous lymphadenitis is a chronic disease caused by Corynebacterium pseudotuberculosis (C.pseudotuberculosis) which causes great economic waste in the small ruminants industry. In order to obtain detailed information about the pathogenesis and host immune response in naturally infected sheep, the gene expression difference was analyzed by high-throughput sequencing. An average of 26 796 transcripts were detected, representing 63% of all known sheep transcripts. Of the approximately 32 million sequences analyzed, 55-58% of reads were unambiguously mapped to the sheep reference genome. Resistant ewes from the affected herd had a total of 245 differentially expressed genes (DEG) compared to control, healthy females. A total of 195 DEG was evaluated in sick ewes. Cps infection has been the cause of increased regulation of 57 biological processes, mainly cell cycle, mitosis, meiosis, segregation of chromosomes and organelles, including control of these processes. Differentially expressed genes were classified into 54 different metabolic and signaling biochemical pathways that were affected by Cps infection and CLA disease. A total of 21 involved signaling pathways can be considered as controlling the immune response and maintaining homeostasis of a healthy organism.

Druh

O - Ostatní výsledky

CEP obor

—

OECD FORD obor

40203 - Husbandry

Projekt

<a href="/cs/project/QK1910082" target="_blank" >QK1910082: Řešení problematiky výskytu bakteriálních, protozoárních a virových zoonotických agens v chovech malých přežvýkavců</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2021

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů