Výskyt genů pro rezistence k antibiotikům u bakteriální mikroflóry vod akvarijních ryb

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F14%3A%230001258" target="_blank" >RIV/00027162:_____/14:#0001258 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://vetweb.cz/" target="_blank" >http://vetweb.cz/</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Výskyt genů pro rezistence k antibiotikům u bakteriální mikroflóry vod akvarijních ryb

Popis výsledku v původním jazyce

V této práci jsme charakterizovali frekvenci výskytu vybraných genů pro rezistence k antibiotikům u bakteriální mikroflóry z vody akvarijních ryb bezprostředně po importu do České republiky. Celkem 48 vzorků pocházelo ze tří různých kontinentů. Kvantifikace pomocí real-time PCR ukázala, že gen sul1 byl přítomen u 11 ze 100 bakterií tvořících mikroflóru vody importovaných akvarijních ryb. tet(A) gen byl přítomen u šesti ze 100 bakterií a geny strA, tet(G), sul2 a aadA byly přítomny v 1-2 kopiích na 100 bakterií. Složení bakteriální mikroflóry bylo stanoveno pyrosekvenováním V3/V4 variabilní oblasti genů pro 16S rRNA. Mikroflóra vod akvarijních ryb po importu byla tvořena zejména zástupci kmenů Proteobacteria (48 %), Bacteroidetes (29,5 %), Firmicutes (17,8 %), Actinobacteria (2,1 %) a Fusobacteria (1,6 %). Korelační analýza mezi frekvencí výskytu genů pro rezistence k antibiotikům a složením mikroflóry ukázala, že hlavními rezervoáry genů sul1, sul2, tet(A), tet(B), cat, strA a aadA jso

Název v anglickém jazyce

Characterization of antibiotic resistance genes in microbiota of carriage water of ornamental fish

Popis výsledku anglicky

In this study we characterized the prevalence of selected antibiotic resistance genes in the microbiota found in the carriage water of ornamental fish imported to the Czech Republic from 3 different continents. Real-time PCR quantification showed that the sul1 gene was present in 11 out of 100 bacteria. tet(A) was present in 6 out of 100 bacteria and strA, tet(G), sul2 and aadA were present in 1 - 2 copies per 100 bacteria. The microbiota characterized by pyrosequencing of the V3/V4 variable region of 16S rRNA genes consisted of Proteobacteria (48 %), Bacteroidetes (29.5 %), Firmicutes (17.8 %), Actinobacteria (2.1 %) and Fusobacteria (1.6 %). Correlation analysis between antibiotic resistance gene prevalence and microbiota composition verified by bacterial culture showed that major reservoirs of sul1 sul2, tet(A), tet(B), cat, strA a aadA could be found among Alpha-, Beta- and Gammaproteobacteria with representatives of Enterobacteriaceae, Pseudomonadaceae, Rhizobiaceae and Comamonada

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

GJ - Choroby a škůdci zvířat, veterinární medicina

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/ED0006%2F01%2F01" target="_blank" >ED0006/01/01: Centrum pro aplikovanou mikrobiologii a imunologii ve veterinární medicíne</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2014

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Veterinářství

ISSN

0506-8231

e-ISSN

—

Svazek periodika

64

Číslo periodika v rámci svazku

12

Stát vydavatele periodika

CZ - Česká republika

Počet stran výsledku

4

Strana od-do

976-979

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—