Set ke stanovení minimálních inhibičních koncentrací antimikrobiálních látek u Pseudomonas spp.

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F17%3AN0000164" target="_blank" >RIV/00027162:_____/17:N0000164 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://www.vri.cz/userfiles/file/Funkcni_vzorek/2017/VUVeL-Funkcni_vzorek-5454-Nedbalcova-Set_ke_stanoveni_minimalnich_inhib_koncentr_antimikrob_latek_u_Pseudomonas_spp.pdf" target="_blank" >https://www.vri.cz/userfiles/file/Funkcni_vzorek/2017/VUVeL-Funkcni_vzorek-5454-Nedbalcova-Set_ke_stanoveni_minimalnich_inhib_koncentr_antimikrob_latek_u_Pseudomonas_spp.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Set ke stanovení minimálních inhibičních koncentrací antimikrobiálních látek u Pseudomonas spp.

Popis výsledku v původním jazyce

Výsledek je diagnostický set pro laboratorní in vitro stanovení citlivosti/rezistence klinických izolátů – humánních patogenů - gramnegativních bakterií rodu Pseudomonas na základě stanovení minimálních inhibičních koncentrací (MIC) mikrodiluční metodou ke 12 antibiotikům (piperacilin, kombinace piperacilinu s tazobaktamem, aztreonam, meropenem, ceftazidim, cefoperazon, cefepim, gentamicin, amikacin, kolistin, ofloxacin a ciprofloxacin). Jedná se o mikrotitrační destičku s 96 jamkami - 12 sloupců (1-12) a 8 řádků (A-H). Ve sloupcích je v růstovém médiu naředěno dvanáct antibiotik používaných k léčbě infekcí lidí způsobených pseudomonádami v objemu 100 µl, u jedenácti antibiotik (sloupce 1-11) je na destičce 8 ředění (řádky A-H) a u jednoho antibiotika (sloupec 12) je 7 ředění (řádky B-H) a v řádku A je jamka s 200 µl média bez antibiotika sloužící jako pozitivní kontrola růstu testovaných bakterií. Počáteční koncentrace jednotlivých antibiotik na destičce jsou rozdílné a jsou voleny tak, aby hodnoty MIC vyšetřovaných bakterií zahrnovaly rozmezí breakpointů citlivosti/rezistence podle závazných mezinárodních metodik Clinical Laboratory Standards Institute (CLSI) a European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST) rozmezí hodnot MIC bakteriálních kmenů povinně testovaných v rámci kontroly kvality, které je pro jednotlivá antibiotika rozdílné. Pro pseudomonády je použito růstové médium CAMHB – kation adjusted Mueller-Hinton Broth (CLSI, EUCAST). Součástí funkčního vzorku je i doporučená interpretace výsledků stanovení MIC pomocí tzv. klinických breakpointů antimikrobiálních látek (EUCAST, CLSI). Vyšetřovaný kmen bakterie lze kategorizovat za předpokladu, že příslušné breakpointy jsou použity v definovaném fenotypovém systému, to znamená, že uvedené breakpointy platí pouze pro pseudomonády. Breakpointy rozdělují izoláty na citlivé, intermediální a rezistentní na základě zjištěné hodnoty MIC, tzn., že je definováno pro každé antibiotikum zvlášť (breakpointy se liší) rozmezí hodnot MIC pro citlivé, intermediální a rezistentní kmeny. Funkčnost setu byla ověřena testováním kontrolního kmene Pseudomonas aeruginosa ATCC 27853, který je přesně definován a povolené rozmezí zjišťovaných hodnot MIC k antibiotikům obsaženým v setu jsou uvedeny v laboratorních standardech CLSI a EUCAST. Stanovené hodnoty MIC jednotlivých antibiotik musí být v rozmezí definovaných hodnot MIC referenčních kmenů dle CLSI a EUCAST. Vývoj a výroba nového setu ke stanovení rezistencí gramnegativních humánních bakteriálních patogenů – pseudomonád - k antimikrobikům reaguje na aktuální potřebu diagnostických laboratoří a nabízí řešení problému novým diagnostickým nástrojem, který může v současnosti dostupným podobným výrobkům konkurovat kvalitou provedení, originalitou a příznivou cenou.

Název v anglickém jazyce

The set for defermination of minimal inhibitory concentrations of antimicrobals in Pseudomonas spp.

Popis výsledku anglicky

The result is a diagnostic set for laboratory in vitro sensitivity / resistance assessment of clinical isolates - human pathogens - Gram-negative bacteria of the genus Pseudomonas based on the determination of minimum inhibitory concentrations (MIC) by microdilution method to 12 antibiotics (piperacillin, piperacillin combination with tazobactam, aztreonam, meropenem, ceftazidime, cefoperazone, cefepim, gentamicin, amikacin, colistin, ofloxacin and ciprofloxacin). It is a 96-well microtiter plate - 12 columns (1-12) and 8 rows (A-H). Twelve antibiotics used to treat 100 μl pseudomonads infections in the growth media are administered in the growth medium, with 11 antibiotics (columns 1-11) being on the plate 8 dilutions (AH lines) and one antibiotic (column 12) being 7 dilutions BH lines) and line A is a well with 200 μl antibiotic free media serving as a positive control of the growth of the test bacteria. The initial concentrations of individual antibiotics on the plate are different and are chosen such that the MIC values of the investigated bacteria include a range of sensitivity / resistance breakpoints according to the binding international methodologies of the Clinical Laboratory Standards Institute (CLSI) and the European Committee for Antimicrobial Susceptibility Testing (EUCAST) range of MIC values of bacterial strains which are compulsorily tested for quality control, which is different for each antibiotic. For pseudomonads, CAMHB-cation adjusted Mueller-Hinton Broth growth medium (CLSI, EUCAST) is used. Part of the functional sample is also the recommended interpretation of MIC assay results using so-called clinical breakpoints of antimicrobial agents (EUCAST, CLSI). The bacteria strain being investigated can be categorized, provided that the respective breakpoints are used in a defined phenotypic system, that is, that the breakpoints are valid only for pseudomonads. The breakpoints divide the isolates into sensitive, intermediate, and resistant based on the MIC value, that is, the range of MIC values for sensitive, intermediate and resistant strains is defined separately for each antibiotic (breakpoints). The functionality of the kit was verified by testing the control strain Pseudomonas aeruginosa ATCC 27853, which is precisely defined, and the allowed range of MIC assay values for the antibiotics contained in the kit are listed in the CLSI and EUCAST laboratory standards. The MIC values of each antibiotic must be within the defined CLSI and EUCAST defined MIC reference ranges. The development and production of a new set of gram-negative bacterial pathogens - pseudomonads - to antimicrobial reagents responds to the current need for diagnostic laboratories and offers a solution to the problem with a new diagnostic tool that can currently compete with the quality of design, originality and a favorable price.

Druh

G_funk - Funkční vzorek

CEP obor

—

OECD FORD obor

30303 - Infectious Diseases

Projekt

<a href="/cs/project/TG03010038" target="_blank" >TG03010038: Rozvoj systému podpory "Proof-of-concept" na VÚVeL</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2017

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

FV- Set na stanovení MIC – Pseudomonas spp.

Číselná identifikace

ISBN 978-80-88233-17-6

Technické parametry

Výsledek vznikl v rámci grantu TAČR GAMA a v souladu se zadávací dokumentací projektu bude komercializován v následujícím období po ukončení řešení.

Ekonomické parametry

Ekonomické přínosy využívání výsledku lze rozdělit minimálně na dvě oblasti – zisk diagnostických laboratoří prováděním stanovení citlivosti/rezistence anaerobních bakterií k antibiotikům a ekonomický přínos pro chovatele hospodářských zvířat. Ekonomický přínos pro laboratoře bude představovat zisk z provedených vyšetření. Za předpokladu vyšetření v jedné laboratoři cca 500 vzorků ročně při ceně za jedno vyšetření kolem 500,- Kč, by se zisk 20 % z tržeb mohl pohybovat kolem 50 tis. pro jednu laboratoř. Dalším uživatelům výsledků vyšetření - chovatelům hospodářských zvířat se sníží zlepšením diagnostiky ekonomické náklady na léčbu a prevenci onemocnění a zvýší se tržby za prodej zdravotně nezávadných kvalitních potravin a surovin živočišného původu. Přesné vyčíslení přínosů chovatelům není možné, záleží vždy na zdravotní situaci a způsobu managementu v jednotlivých chovech.

Kategorie aplik. výsledku dle nákladů

—

IČO vlastníka výsledku

00027162

Název vlastníka

Výzkumný ústav veterinárního lékařství, v.v.i.

Stát vlastníka

CZ - Česká republika

Druh možnosti využití

N - Využití výsledku jiným subjektem je možné bez nabytí licence (výsledek není licencován)

Požadavek na licenční poplatek

—

Adresa www stránky s výsledkem

https://www.vri.cz/userfiles/file/Funkcni_vzorek/2017/VUVeL-Funkcni_vzorek-5454-Nedbalcova-Set_ke_stanoveni_minimalnich_inhib_koncentr_antimikrob_latek_u_Pseudomonas_spp.pdf