Zoonotický význam kmenů Escherichia coli izolovaných ze skotu a prasat

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F18%3AN0000030" target="_blank" >RIV/00027162:_____/18:N0000030 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/62157124:16270/18:43877123

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Zoonotický význam kmenů Escherichia coli izolovaných ze skotu a prasat

Popis výsledku v původním jazyce

Cíl práce: Cílem této studie bylo sledovat vlastnosti Shiga toxin produkujících kmenů Escherichia coli (STEC) získaných od zvířat s ohledem na příslušnost k séroskupině, typ a subtyp Shiga toxinu a adherenčí faktor intimin. Na základě výsledků vyhodnotit výskyt jednotlivých subtypů Shiga toxinů a možný význam kmenů pro humánní populaci. Materiál a metody: Do studie bylo zařazeno 131 kmenů STEC, které pocházely z rektálních výtěrů skotu (80) a prasat (51) odebraných na farmách České republiky v letech 2000 - 2017. Vybrané kmeny se lišily původem a příslušností k somatickému antigenu. Metodou PCR byla ověřena přítomnost Shiga toxinů, intiminu a stanoveny subtypy Shiga toxinů stx1a, stx1c, stx1d, stx2a, stx2b, stx2c, stx2d, stx2e, stx2g. Výsledky: Gen stx1 byl potvrzen u 33 % kmenů (43/131), gen stx2 u 55 % (72/131) a 16 kmenů neslo geny pro oba toxiny současně (12 %). Kmenů se schopností tvořit intimin bylo detekováno 46 (35 %), většinou v rektálních výtěrech skotu. Kmeny ze skotu náležely k 21 různým séroskupinám. Převažoval u nich výskyt Shiga toxinu 1 (55, 69 %) se subtypy stx1a (54) a stx1d (1). Shiga toxin 2 byl potvrzen u 39 kmenů (49 %). Detekovány byly tyto varianty stx2a (9), stx2e (6) a stx2g (3), stx2a, stx2c (5), stx2a, stx2b (1) a stx2c, stx2d (1). Dále byla zjištěna kombinace stx1a, stx2a (12) a stx1a, stx2c (2). Většina z těchto kmenů (44; 55 %) nesla současně i gen eae. Kmeny z prasat náležely k 5 séroskupinám. Dominantně byl prokázán Shiga toxin 2 (49; 96 %) a subtypy stx2e (42), stx2a (7). Shiga toxin 1 byl detekován u 4 kmenů, a to subtyp stx1a (1), stx1c (1) a v kombinaci stx1a, stx2a (2). Pouze u 2 kmenů byl prokázán i gen eae. Závěr: Kmeny STEC izolované ze skotu náležely k většímu spektru séroskupin, byly častěji vybaveny adherenčním faktorem intiminem a byly vybaveny více variantami Shiga toxinů, včetně těch prokazatelně spojených se závažným onemocněním lidí, než kmeny z prasat. V souboru izolátů z prasat prevaloval gen stx2e, jehož význam pro člověka nebyl zcela objasněn.

Název v anglickém jazyce

Zoonotic significance of Escherichia coli strains isolated from cattle and pigs

Popis výsledku anglicky

Objectives: The aim of this study was to monitor characteristics of Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC) obtained from animals according to the serogroup they belonged to, Shiga toxin type and subtype and adhesion factor intimin. Then based on the results to evaluate the occurrence of Shiga toxins subtypes and their possible significance for humans. Materials and methods: The study included 131 STEC strains isolated from rectal swabs of cattle (80) and pigs (51) sampled on farms of the Czech Republic from 2000 to 2017. Selected strains differed in origin and serogroup. The presence of Shiga toxins, intimin and the Shiga toxin subtypes stx1a, stx1c, stx1d, stx2a, stx2b, stx2c, stx2d, stx2e, stx2g was determined by PCR method. Results: The stx1 gene was confirmed in 33% of the strains (43/131), the stx2 gene in 55% (72/131) and 16 strains carried the genes for both toxins simultaneously (12%). Strains harbouring the eae gene were detected in 46 (35%) cases, mostly in rectal swabs of cattle. STEC from cattle belonged to 21 different serogroups. The presence of the Shiga toxin 1 predominated in these strains with subtypes stx1a (54) and stx1d (1). The Shiga toxin 2 was confirmed in 39 of the bovine strains with the following subtypes stx2a (9), s stx2e (6), stx2g (3), stx2a, stx2c (5), stx2a, stx2b (1) and stx2c, stx2d (1). Also the combination of stx1a, stx2a (12) and stx1a, stx2c (2) was detected. STEC from pigs belonged to 5 different serogroups. The Shiga toxin 2 was the most often detected (49; 96%) with subtypes stx2e (42) and stx2a (7). The Shiga toxin 1 was detected in 4 strains (8%), as subtypes stx1a (1) and stx1c (1) and also in the combination stx1a, stx2a (2). Conclusion: STEC strains isolated from cattle, compared to pigs, belonged to the larger spectrum of serogroups, they more often carried adherence factor intimin and the diversity of Shiga toxin-subtpypes was higher, including those associated with serious human disease. In the set of isolates from pigs, the stx2e gene predominated, its significance for human health has not been fully clarified yet.

Druh

J_SC - Článek v periodiku v databázi SCOPUS

CEP obor

—

OECD FORD obor

10606 - Microbiology

Projekt

<a href="/cs/project/LO1218" target="_blank" >LO1218: Zdravé zvíře jako zdroj zdravé potraviny</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2018

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Klinická mikrobiologie a infekční lékařství

ISSN

1211-264X

e-ISSN

—

Svazek periodika

24

Číslo periodika v rámci svazku

2

Stát vydavatele periodika

CZ - Česká republika

Počet stran výsledku

5

Strana od-do

36-40

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

2-s2.0-85061381882