Multiplexní nástroj pro rychlou detekci patogenních virů spojených s kontaminovanou vodou a prostředím

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F21%3AN0000087" target="_blank" >RIV/00027162:_____/21:N0000087 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/00216224:14310/21:00123951

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Multiplexní nástroj pro rychlou detekci patogenních virů spojených s kontaminovanou vodou a prostředím

Popis výsledku v původním jazyce

Konference mikrobiologie vody a prostředí, Hotel Kamzík, Malá Morávka, termín konání 9.-11.6.2021. Virová agens se v poslední době dostávají do popředí zájmu, a to i ve spojitosti s možnou kontaminací vodních zdrojů a prostředí. Nejčastějšími následky onemocnění, která se s těmito kontaminacemi pojí, jsou gastroenteritidy projevující se horečkou, zvracením a vodnatými průjmy. Kromě mírných horečnatých onemocnění však mohou viry způsobovat i závažnější stavy – infekce dýchacího ústrojí, hepatitidy, konjunktivitidy, aseptické meningitidy, myokarditidy, encefalitidy či paralýzy. V současnosti rutinně používané metody pro detekci těchto agens mají své limity. Jedním z nejpodstatnějších je omezená možnost vytvářet multiplexní systémy pro detekci většího množství patogenů současně. Z tohoto důvodu jsme vyvinuli nový detekční nástroj, který nám toto omezení umožní překonat. Zkombinovali jsme metodu multiplexní ligační reakce a PCR s komerčně dostupnou technologií xMAP (Luminex corporation, Texas, USA). Kombinace těchto metod nám umožňuje vytvářet otevřené detekční systémy až pro 50 různých cílů. Pro detekci virů spojených s alimentárními nákazami byl vyvinut a optimalizován panel zahrnující ty nejvíce diskutované původce - noroviry, viry hepatitidy A a E, adenoviry a rotaviry. Spolehlivost tohoto panelu byla ověřena i mezilaboratorními testy, kdy byl potvrzen limit detekce této metody, 5 × 100 až 5 × 101 genomových ekvivalentů v reakci. Tento systém tak představuje rychlou, robustní, spolehlivou a dostatečně citlivou metodu pro možné monitorování a kontrolu mikrobiologické bezpečnosti potravin, vodních zdrojů a prostředí, kromě toho může sloužit i jako pomocný nástroj při epidemiologických šetřeních. V souvislosti s aktuální epidemiologickou situací byl tento detekční panel doplněn o systémy cílené na viry způsobující respirační onemocnění (tzn. původce nového onemocnění COVID-19 a chřipek A a B).

Název v anglickém jazyce

Multiplex tool for rapid detection of pathogenic viruses associated with contaminated water and the environment

Popis výsledku anglicky

Viral agents have recently come to the forefront of interest, even in connection with possible contamination of water and environment. The most common consequences of the diseases associated with these contaminations are gastroenteritides manifested by fever, vomiting and watery diarrhea. However, in addition to mild febrile illness, viruses can also cause more serious conditions - respiratory infections, hepatitis, conjunctivitis, aseptic meningitis, myocarditis, encephalitis or paralysis. Currently routinely used methods for detection of these agents have their limitations. One of the most important is the limited ability to create multiplex systems to detect a large number of pathogens simultaneously. For this reason, we have developed a new detection tool that will allow to overcome this limitation. We combined multiplex ligation reaction and PCR with commercially available xMAP technology (Luminex corporation, Texas, USA). The combination of these methods allows to create open detection systems for up to 50 different targets. To detect viruses associated with food- and water-borne infections, the panel was developed and optimized, including the most discussed agents - noroviruses, hepatitis A and E viruses, adenoviruses and rotaviruses. The reliability of this panel was also verified by interlaboratory ring tests, which confirmed the limit of detection of this method, 5 × 100 to 5 × 101 genomic equivalents in the reaction. This system thus represents a fast, robust, reliable and sufficiently sensitive method for possible monitoring and control of microbiological safety of food, water and environment, and it can also serve as an aid in epidemiological investigations. In connection with the current epidemiological situation, this detection panel was expanded with additional systems targeting viruses causing respiratory diseases (the causative agents of the new disease COVID-19 and influenza A and B).

Druh

O - Ostatní výsledky

CEP obor

—

OECD FORD obor

10607 - Virology

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2021

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů