Diagnostický prostředek pro multiplexní detekci a rozlišení hlavních bakteriálních původců vyvolávajících abscesy u malých přežvýkavců

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F21%3AN0000197" target="_blank" >RIV/00027162:_____/21:N0000197 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://www.vri.cz/wp-content/uploads/2021/11/FV4176_Final_Markova.pdf" target="_blank" >https://www.vri.cz/wp-content/uploads/2021/11/FV4176_Final_Markova.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Diagnostický prostředek pro multiplexní detekci a rozlišení hlavních bakteriálních původců vyvolávajících abscesy u malých přežvýkavců

Popis výsledku v původním jazyce

Metodika funkčního vzorku popisuje PCR s multiplexní oligonukleotidovou ligací (MOL-PCR) pro diagnostiku kaseózní lymfadenitidy (caseous lymphadenitis, CLA) ovcí a koz způsobenou bakterií Corynebacterium pseudotuberculosis, ale i dalších vybraných bakteriálních původců nacházejících se v abscesech malých přežvýkavců (Corynebacterium ulcerans, Staphylococcus aureus, Staphylococcus aureus subspecies anaerobius, Streptococcus spp., Trueperella pyogenes a meticilin-rezistentní S. aureus). Tento diagnostický prostředek umožňuje multiplexní in vitro detekci bakteriální DNA ve vzorcích hnisu z mízních uzlin anebo z abscesů a to v rámci jedné reakce. Diagnostický nástroj také obsahuje interní positivní kontrolu, která slouží pro kontrolu správného průběhu MOL-PCR. Vývoj detekční soupravy v rámci funkčního vzorku je jedním z výstupů při řešení projektu Ministerstva Zemědělství QK1910082.

Název v anglickém jazyce

A diagnostic tool for multiplex detection and differentiation of the main bacterial agents causing abscesses in small ruminants

Popis výsledku anglicky

The functional sample methodology describes PCR with multiplex oligonucleotide ligation (MOL-PCR) for the diagnosis of caseous lymphadenitis (CLA) in sheep and goats caused by Corynebacterium pseudotuberculosis, but also other selected bacterial pathogens found in small ruminant abscesses (Corynebacterium ulcerans, Staphylococcus aureus, Staphylococcus aureus subspecies anaerobius, Streptococcus spp., Trueperella pyogenes and methicillin-resistant S. aureus). This diagnostic tool allows multiplex in vitro detection of bacterial DNA in lymph node pus or abscesses samples in a single reaction. The diagnostic tool also includes an internal positive control to check the correct course of the MOL-PCR. The development of the detection system within the functional sample is one of the outputs of the Ministry of Agriculture project QK1910082.

Druh

G_funk - Funkční vzorek

CEP obor

—

OECD FORD obor

40300 - Veterinary science

Projekt

<a href="/cs/project/QK1910082" target="_blank" >QK1910082: Řešení problematiky výskytu bakteriálních, protozoárních a virových zoonotických agens v chovech malých přežvýkavců</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2021

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

4176/2021

Číselná identifikace

ISBN 978-80-7672-012-1

Technické parametry

Pro vývoj detekčního systému využívající tzv. xMAP technologii na přístrojové platformě MagPix byly vybrány hlavní bakteriální původci vyvolávající abscesy u malých přežvýkavců (Corynebacterium pseudotuberculosis, Corynebacterium ulcerans, Staphylococcus aureus, Staphylococcus aureus subspecies anaerobius, Streptococcus species., Trueperella pyogenes a meticilin-rezistentní S. aureus). Diagnostický systém využívá kombinaci xMAP technologie (Luminex corporation, USA), ligační reakce a polymerázové řetězové reakce (PCR) se specifickými oligonukleotidy cílenými na unikátní oblasti v genomu těchto vybraných bakteriálních druhů. Součástí každé reakce je také interní kontrola, která slouží ke kontrole průběhu PCR a odhaluje možnou falešnou negativitu způsobenou inhibicí u analyzovaného vzorku.

Ekonomické parametry

Pro diagnosticky vybavenou laboratoř spočívají náklady v syntéze oligonukleotidů a pořízení spotřebního materiálu, soupravy pro izolaci DNA, chemikálií a enzymů pro ligační esej, PCR reakci a hybridizaci včetně magnetických mikrosfér. Cena materiálu na vyšetření jednoho vzorku v duplikátu se pohybuje kolem 600 Kč (bez DPH). Při zavedení funkčního vzorku do diagnostické praxe se ušetří čas i náklady spojené s analýzou.

Kategorie aplik. výsledku dle nákladů

—

IČO vlastníka výsledku

00027162

Název vlastníka

Výzkumný ústav veterinárního lékařství, v.v.i.

Stát vlastníka

CZ - Česká republika

Druh možnosti využití

A - K využití výsledku jiným subjektem je vždy nutné nabytí licence

Požadavek na licenční poplatek

A - Poskytovatel licence na výsledek požaduje licenční poplatek

Adresa www stránky s výsledkem

https://www.vri.cz/wp-content/uploads/2021/11/FV4176_Final_Markova.pdf