Databáze kmenů bakterie Corynebacterium pseudotuberculosis získaných z chovů ovcí a koz v České republice

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00027162%3A_____%2F23%3AN0000207" target="_blank" >RIV/00027162:_____/23:N0000207 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Databáze kmenů bakterie Corynebacterium pseudotuberculosis získaných z chovů ovcí a koz v České republice

Popis výsledku v původním jazyce

Tato databáze bakteriálních kmenů Corynebacterium pseudotuberculosis vznikla v průběhu pětiletého projektu NAZV QK 1910082. Izoláty byly získány na farmách v České republice z hnisavých lézí spojených s povrchovými lymfatickými uzlinami nebo lokalizovanými v podkoží a vnitřních orgánech ovcí a koz pozitivních na kaseózní lymfadenitidu. Jednotlivé bakteriální kmeny byly detailně identifikovány s využitím metody celogenomového sekvenování (WGS) a charakterizovány fenotypovými testy (schopnost tvorby biofilmu, rezistence k antibiotikům a desinfekčním látkám) i pomocí bioinformatické analýzy (např. genomická detekce faktorů virulence). Databáze je určena odborné veřejnosti k doplnění dat o kmenech C. pseudotuberculosis biovar ovis získaných na území našeho státu. Databáze je zveřejněna na webových stránkách Výzkumného ústavu veterinárního lékařství, v. v. i. v sekci Oddělení mikrobiologie a antimikrobiální rezistence – skupina Probiotika a zdraví zvířat.

Název v anglickém jazyce

Database of Corynebacterium pseudotuberculosis strains obtained from sheep and goat farms in the Czech Republic

Popis výsledku anglicky

This database of Corynebacterium pseudotuberculosis bacterial strains was created during the five-year project NAZV QK 1910082. Isolates were obtained on farms in the Czech Republic from purulent lesions associated with superficial lymph nodes or localized in the subcutaneous and internal organs of sheep and goats positive for caseous lymphadenitis. Individual bacterial strains were identified in detail using whole genome sequencing (WGS) and characterized by phenotypic tests (biofilm formation, resistance to antibiotics and disinfectants) and bioinformatic analysis (e.g. genomic detection of virulence factors). The database is intended for the professional community to supplement the data on C. pseudotuberculosis biovar ovis strains obtained in our country. The database is published on the website of the Veterinary Research Institute in the section Department of Microbiology and antimicrobial resistance - group Probiotics and Animal Health.

Druh

O - Ostatní výsledky

CEP obor

—

OECD FORD obor

40301 - Veterinary science

Projekt

<a href="/cs/project/QK1910082" target="_blank" >QK1910082: Řešení problematiky výskytu bakteriálních, protozoárních a virových zoonotických agens v chovech malých přežvýkavců</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2023

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů