PMD patient mutations reveal a long-distance intronic interaction that regulates PLP1/DM20 alternative splicing

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00064203%3A_____%2F14%3A10292976" target="_blank" >RIV/00064203:_____/14:10292976 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/00216208:11130/14:10292976

Výsledek na webu

<a href="http://dx.doi.org/10.1093/hmg/ddu271" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1093/hmg/ddu271</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1093/hmg/ddu271" target="_blank" >10.1093/hmg/ddu271</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

PMD patient mutations reveal a long-distance intronic interaction that regulates PLP1/DM20 alternative splicing

Popis výsledku v původním jazyce

Alternative splicing of the proteolipid protein 1 gene (PLP1) produces two forms, PLP1 and DM20, due to alternative use of 5' splice sites with the same acceptor site in intron 3. The PLP1 form predominates in central nervous system RNA. Mutations that reduce the ratio of PLP1 to DM20, whether mutant or normal protein is formed, result in the X-linked leukodystrophy Pelizaeus-Merzbacher disease (PMD). We investigated the ability of sequences throughout PLP1 intron 3 to regulate alternative splicing using a splicing minigene construct transfected into the oligodendrocyte cell line, Oli-neu. Our data reveal that the alternative splice of PLP1 is regulated by a long-distance interaction between two highly conserved elements that are separated by 581 baseswithin the 1071-base intron 3. Further, our data suggest that a base-pairing secondary structure forms between these two elements, and we demonstrate that mutations of either element designed to destabilize the secondary structure decrea

Název v anglickém jazyce

PMD patient mutations reveal a long-distance intronic interaction that regulates PLP1/DM20 alternative splicing

Popis výsledku anglicky

Alternative splicing of the proteolipid protein 1 gene (PLP1) produces two forms, PLP1 and DM20, due to alternative use of 5' splice sites with the same acceptor site in intron 3. The PLP1 form predominates in central nervous system RNA. Mutations that reduce the ratio of PLP1 to DM20, whether mutant or normal protein is formed, result in the X-linked leukodystrophy Pelizaeus-Merzbacher disease (PMD). We investigated the ability of sequences throughout PLP1 intron 3 to regulate alternative splicing using a splicing minigene construct transfected into the oligodendrocyte cell line, Oli-neu. Our data reveal that the alternative splice of PLP1 is regulated by a long-distance interaction between two highly conserved elements that are separated by 581 baseswithin the 1071-base intron 3. Further, our data suggest that a base-pairing secondary structure forms between these two elements, and we demonstrate that mutations of either element designed to destabilize the secondary structure decrea

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

FH - Neurologie, neurochirurgie, neurovědy

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/NT14348" target="_blank" >NT14348: Využití nových sekvenčních a genotypizačních metod DNA analýzy pro efektivní diagnostiku méně častých a nových typů dědičné neuropatie Charcot-Marie-Tooth.</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2014

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Human Molecular Genetics

ISSN

0964-6906

e-ISSN

—

Svazek periodika

23

Číslo periodika v rámci svazku

20

Stát vydavatele periodika

GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

Počet stran výsledku

15

Strana od-do

5464-5478

Kód UT WoS článku

000343202400014

EID výsledku v databázi Scopus

—