Contribution of PCR Denaturing Gradient Gel Electrophoresis Combined with Mixed Chromatogram Software Separation for Complex Urinary Sample Analysis

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00159816%3A_____%2F17%3A00068313" target="_blank" >RIV/00159816:_____/17:00068313 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/00216224:14110/17:00095700 RIV/00209775:_____/17:N0000015

Výsledek na webu

<a href="http://dx.doi.org/10.1159/000484524" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1159/000484524</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1159/000484524" target="_blank" >10.1159/000484524</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Contribution of PCR Denaturing Gradient Gel Electrophoresis Combined with Mixed Chromatogram Software Separation for Complex Urinary Sample Analysis

Popis výsledku v původním jazyce

Complex samples are a challenge for sequencing-based broad-range diagnostics. We analysed 19 urinary catheter, ureteral Double-J catheter, and urine samples using 3 methodological approaches. Out of the total 84 operational taxonomic units, 37, 61, and 88% were identified by culture, PCR-DGGE-SS (PCR denaturing gradient gel electrophoresis followed by Sanger sequencing), and PCR-DGGE-RM (PCR-DGGE combined with software chromatogram separation by RipSeq Mixed tool), respectively. The latter approach was shown to be an efficient tool to complement culture in complex sample assessment. (C) 2017 S. Karger AG, Basel

Název v anglickém jazyce

Contribution of PCR Denaturing Gradient Gel Electrophoresis Combined with Mixed Chromatogram Software Separation for Complex Urinary Sample Analysis

Popis výsledku anglicky

Complex samples are a challenge for sequencing-based broad-range diagnostics. We analysed 19 urinary catheter, ureteral Double-J catheter, and urine samples using 3 methodological approaches. Out of the total 84 operational taxonomic units, 37, 61, and 88% were identified by culture, PCR-DGGE-SS (PCR denaturing gradient gel electrophoresis followed by Sanger sequencing), and PCR-DGGE-RM (PCR-DGGE combined with software chromatogram separation by RipSeq Mixed tool), respectively. The latter approach was shown to be an efficient tool to complement culture in complex sample assessment. (C) 2017 S. Karger AG, Basel

Druh

J_imp - Článek v periodiku v databázi Web of Science

CEP obor

—

OECD FORD obor

10606 - Microbiology

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2017

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Journal Of Molecular Microbiology And Biotechnology

ISSN

1464-1801

e-ISSN

—

Svazek periodika

27

Číslo periodika v rámci svazku

6

Stát vydavatele periodika

CH - Švýcarská konfederace

Počet stran výsledku

6

Strana od-do

350-355

Kód UT WoS článku

000426010400003

EID výsledku v databázi Scopus

—