Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Functional analysis of the p.(Leu15Pro) and p.(Gly20Arg) sequence changes in the signal sequence of LDL receptor

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00209775%3A_____%2F16%3AN0000018" target="_blank" >RIV/00209775:_____/16:N0000018 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/00216224:14740/16:00087619 RIV/65269705:_____/16:00066094

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.atherosclerosis.2016.04.022" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1016/j.atherosclerosis.2016.04.022</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.atherosclerosis.2016.04.022" target="_blank" >10.1016/j.atherosclerosis.2016.04.022</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Functional analysis of the p.(Leu15Pro) and p.(Gly20Arg) sequence changes in the signal sequence of LDL receptor

  • Popis výsledku v původním jazyce

    The low density lipoprotein receptor (LDLR) is a transmembrane protein that plays a key role in cholesterol metabolism. It contains 860 amino acids including a 21 amino acid long signal sequence, which directs the protein into the endoplasmic reticulum. Mutations in the LDLR gene lead to cholesterol accumulation in the plasma and results in familial hypercholesterolemia (FH). Knowledge of the impact of a mutation on the LDLR protein structure and function is very important for the diagnosis and management of FH. Unfortunately, for a large proportion of mutations this information is still missing. In this study, we focused on the LDLR signal sequence and carried out functional and in silico analyses of two sequence changes, p.(Gly20Arg) and p.(Leu15Pro), localized in this part of the LDLR. Our results revealed that the p.(Gly20Arg) change, previously described as disease causing, has no detrimental effect on protein expression or LDL particle binding. In silico analysis supports this observation, showing that both the wt and p.(Gly20Arg) signal sequences adopt an expected α-helix structure. In contrast, the mutation p.(Leu15Pro) is not associated with functional protein expression and exhibits a structure with disrupted a α-helical arrangement in the signal sequence, which most likely affects protein folding in the endoplasmic reticulum.

  • Název v anglickém jazyce

    Functional analysis of the p.(Leu15Pro) and p.(Gly20Arg) sequence changes in the signal sequence of LDL receptor

  • Popis výsledku anglicky

    The low density lipoprotein receptor (LDLR) is a transmembrane protein that plays a key role in cholesterol metabolism. It contains 860 amino acids including a 21 amino acid long signal sequence, which directs the protein into the endoplasmic reticulum. Mutations in the LDLR gene lead to cholesterol accumulation in the plasma and results in familial hypercholesterolemia (FH). Knowledge of the impact of a mutation on the LDLR protein structure and function is very important for the diagnosis and management of FH. Unfortunately, for a large proportion of mutations this information is still missing. In this study, we focused on the LDLR signal sequence and carried out functional and in silico analyses of two sequence changes, p.(Gly20Arg) and p.(Leu15Pro), localized in this part of the LDLR. Our results revealed that the p.(Gly20Arg) change, previously described as disease causing, has no detrimental effect on protein expression or LDL particle binding. In silico analysis supports this observation, showing that both the wt and p.(Gly20Arg) signal sequences adopt an expected α-helix structure. In contrast, the mutation p.(Leu15Pro) is not associated with functional protein expression and exhibits a structure with disrupted a α-helical arrangement in the signal sequence, which most likely affects protein folding in the endoplasmic reticulum.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    FB - Endokrinologie, diabetologie, metabolismus, výživa

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2016

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Atherosclerosis

  • ISSN

    0021-9150

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    250

  • Číslo periodika v rámci svazku

    July

  • Stát vydavatele periodika

    NL - Nizozemsko

  • Počet stran výsledku

    6

  • Strana od-do

    9-14

  • Kód UT WoS článku

  • EID výsledku v databázi Scopus