Kvantifikace proteinových biomarkerů pomocí hmotnostní spektrometrie pracující v režimu monitorování vybraných reakcí

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00209805%3A_____%2F11%3A%230000153" target="_blank" >RIV/00209805:_____/11:#0000153 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://www.chemicke-listy.cz/docs/full/2011_11_846-850.pdf" target="_blank" >http://www.chemicke-listy.cz/docs/full/2011_11_846-850.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Kvantifikace proteinových biomarkerů pomocí hmotnostní spektrometrie pracující v režimu monitorování vybraných reakcí

Popis výsledku v původním jazyce

Monitorování vybraných reakcí (SRM) patří do kvantitativních metod hmotnostní spektrometrie, které lze také uplatnit v analýze peptidů. Hmotnostní spektrometry určené pro SRM analýzu jsou spojeny s nanoHPLC, mají iontový zdroj nanoelektrosprej a trojitýkvadrupólový analyzátor. V prinicpu, první kvadrupol funguje jako hmotnostní filtr, který propustí pouze vybraný peptidový iont, který je fragmentován v druhém kvadrupólu quadupole přes kolizní celu. Třetí kvadrupól přenáší vybrané peptidocé fragmenty směrem k detektoru. Tento přístup umožňuje cílenou kvantifikaci desítek proteinů v rámci jediné analýzy a to s velmi dobrou citlivostí a selektivností. SRM se tak stává klíčovou metodou proteomiky. Hlavním odvětvím jejího použití spočívá v rychlém stanovení proteinů v rámci rozsáhlých souborů vzorků.

Název v anglickém jazyce

Quantitation of protein biomarkers by mass spectrometry in selected reaction monitoring mode

Popis výsledku anglicky

Selected reaction monitoring (SRM) is a quantitative MS-based method which recently expanded to analysis of proteins by determination of peptides. The instrumentation consists of a nanoflow liquid chromatograph coupled with nanoelectrospray ionization and a triple-quadrupole mass spectrometer. In principle, the first quadrupole works as a mass filter, transmitting only a selected peptide, which is fragmented in a second quadupole via collision-induced dissociation. The third quadrupole transmits the selected peptide fragments, which are then directed to the detector. This approach enables targeted quantification of tens of proteins in a single analysis with very good sensitivity and selectivity. The SRM becomes a key method in a new targeted-proteomicstoolbox. The most important field of its applications lies in the life sciences research where SRM enables fast, accurate and cost-effective determination of proteins in large sets of samples.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2011

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Chemické listy

ISSN

1213-7103

e-ISSN

—

Svazek periodika

105

Číslo periodika v rámci svazku

11

Stát vydavatele periodika

CZ - Česká republika

Počet stran výsledku

5

Strana od-do

846-850

Kód UT WoS článku

000297567400004

EID výsledku v databázi Scopus

—