Kvantifikace proteinových biomarkerů pomocí hmotnostní spektrometrie pracující v režimu monitorování vybraných reakcí

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14310%2F11%3A00050154" target="_blank" >RIV/00216224:14310/11:00050154 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/60162694:G44__/11:00002436 RIV/00209805:_____/11:#0000153

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Kvantifikace proteinových biomarkerů pomocí hmotnostní spektrometrie pracující v režimu monitorování vybraných reakcí

Popis výsledku v původním jazyce

Monitorování vybraných reakcí (selected reaction monitoring, SRM) je kvantitativní hmotnostně-spektrometrická technika, která se stále více uplatňuje v kvantitativní analýze proteinů na bázi stanovení peptidů. Instrumentace sestává z nanoprůtokové kapalinové chromatografie spojené s ionizací elektrosprejem a hmotnostním spektrometrem na bázi trojitého kavdrupólu. První kvadrupól funguje jako hmotnostní filtr propouštějící vybraný peptid, který je fragmenován ve druhém kvadrupólu pomocí kolizí indukovanédisociace. Třetí kvadrupól propouští vybrané peptidové fragmenty, které následně dopadají na detektor. Tetnto přístup umož%nuje cílenou kvantifikaci desítek proteinů v jediné analýze s vysokou citlivostí a selektivitou. SRM se proto stává klíčovou metodou tzv. cílené proteomiky. Nejdůležitější aplikace spočívají ve výzkumu živých systémů kde SRM umožňuje rychlé, přesné a cenově přijatelné stanovení proteinů ve velkých počtech vzorků.

Název v anglickém jazyce

Mass-Spectrometry Quantification of Protein Biomarkers by Selected Reaction Monitoring

Popis výsledku anglicky

Selected reaction monitoring (SRM) is a quantitative MS-based method which recently expanded to analysis of proteins by determination of peptides. The instrumentation consists of a nanoflow liquid chromatograph coupled with nanoelectrospray ionization and a triple-quadrupole mass spectrometer. In principle, the first quadrupole works as a mass filter, transmitting only a selected peptide, which is fragmented in a second quadupole via collision-induced dissociation. The third quadrupole transmits the selected peptide fragments, which are then directed to the detector. This approach enables targeted quantification of tens of proteins in a single analysis with very good sensitivity and selectivity. The SRM becomes a key method in a new targeted-proteomicstoolbox. The most important field of its applications lies in the life sciences research where SRM enables fast, accurate and cost-effective determination of proteins in large sets of samples.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

CE - Biochemie

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2011

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Chemické listy

ISSN

0009-2770

e-ISSN

—

Svazek periodika

105

Číslo periodika v rámci svazku

11

Stát vydavatele periodika

CZ - Česká republika

Počet stran výsledku

5

Strana od-do

846-850

Kód UT WoS článku

000297567400004

EID výsledku v databázi Scopus

—