Analýza změn fosfoproteomu nádorové buněčné linie MDA-MB-468 v odpovědi na expresi izoforem p63 pomocí hmotnostní spektrometrie

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00209805%3A_____%2F15%3A%230000646" target="_blank" >RIV/00209805:_____/15:#0000646 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://dx.doi.org/10.14735/amko20152S11" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.14735/amko20152S11</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.14735/amko20152S11" target="_blank" >10.14735/amko20152S11</a>

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Analýza změn fosfoproteomu nádorové buněčné linie MDA-MB-468 v odpovědi na expresi izoforem p63 pomocí hmotnostní spektrometrie

Popis výsledku v původním jazyce

Nádorové buňky se od buněk normální tkáně liší mimo jiné aktivací různých signálních drah. Tyto změny jsou podmíněny odlišnou aktivitou kináz a fosfatáz způsobujících rozdíly ve fosforylaci proteinů. Detekce těchto změn je zásadní pro cílenou léčbu zaměřenou na inhibici nebo aktivaci konkrétních signálních drah. Existují různé metody, kterými lze fosforylaci proteinů stanovit. Jednou z vhodných metod schopných charakterizovat fosfoproteom je hmotnostní spektrometrie. Tento článek je zaměřen na analýzu změn ve fosfoproteomu buněčné linie MDA-MB-468 odvozené od nádoru prsu s vnesenými geny kódujícími izoformy proteinu p63. Buňky s tetracyklinem indukovanou expresí izoforem proteinu p63 byly srovnány s kontrolními buňkami s přirozenou expresí p63. Denaturované proteiny z buněčného lyzátu byly nejprve enzymaticky štěpeny na peptidy a následně obohaceny o fosfopeptidy. Měření probíhalo pomocí kapalinového chromatografu spojeného s hmotnostním spektrometrem Orbitrap Elite. Každý vzorek byl a

Název v anglickém jazyce

Analysis of phosphoproteome changes in MDA-MB-468 cancer cell line in response to expression of p63 isoformes using mass spectrometry

Popis výsledku anglicky

Compared to normal cells, tumor cells can show different activity of kinases and phosphatases resulting in altered phosphorylation states of proteins affecting their activity within various signaling pathways. The detection of these alterations is essential for development of targeted therapy based on activation/inhibition of specific signaling pathways. Various methods can be used for detection of protein phosphorylation; however, a comprehensive assessment of phosphoproteome is performed by mass spectrometry. The diff erences in phosphoproteome were studied using MDA-MB-468 cell line (with incorporated genes encoding isoforms of p63) derived from breast carcinoma. Cells with tetracycline-induced expression of the p63 isoforms were compared to controlcells with wild-type expression. Denatured proteins from cell lysates were digested to peptides, enriched for phosphopeptides and subsequently separated using liquid chromatograph coupled with mass spectrometer Orbitrap Elite. Three diff

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2015

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Klinická onkologie

ISSN

0862-495X

e-ISSN

—

Svazek periodika

28

Číslo periodika v rámci svazku

supplementum 2

Stát vydavatele periodika

CZ - Česká republika

Počet stran výsledku

9

Strana od-do

"2S"11-"2S"19

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

2-s2.0-84943381409