Využití mozkomíšního moku pro analýzu mikroRNA

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00209805%3A_____%2F18%3A00078165" target="_blank" >RIV/00209805:_____/18:00078165 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://www.linkos.cz/files/klinicka-onkologie/437.pdf" target="_blank" >https://www.linkos.cz/files/klinicka-onkologie/437.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Využití mozkomíšního moku pro analýzu mikroRNA

Popis výsledku v původním jazyce

Východiska: Deregulované hladiny mikroRNA (miRNA), krátkých nekódujících RNA pojících se s patogenezí mnoha onemocnění, byly pozorovány i v mozkomíšním moku (cerebrospinal fluid - CSF). Analýza miRNA v CSF u pa cientů postižených nádory centrální nervové soustavy (CNS) by mohla pomoci vyvinout novou dia gnostickou platformu umožňující přesnější diagnostiku. Proto se v naší studii snažíme optimalizovat metodické přístupy sloužící pro detekci miRNA, jako je izolace RNA a výběr vhodné technologie pro globální profi lování miRNA v CSF. Materiál a metody: V rámci optimalizace izolace RNA z CSF bylo porovnáváno několik komerčně dostupných izolačních kitů s různými modifi kacemi v protokolu. Při výběru nejvhodnější metody pro vysokokapacitní profi lování miRNA byly testovány dva panely založené na kvantitativní polymerázové řetězové reakci a sekvenování nové generace. Výsledky: Jako nejvhodnější izolační kit byl vyhodnocen Urine miRNA Purifi cation kit (Norgen). Jako nejlepší metoda pro následné vysokokapacitní profi lování miRNA v CSF bylo vybráno sekvenování nové generace. Závěr: Optimalizovali jsme protokol pro izolaci RNA a vysokokapacitní analýzu miRNA v mozkomíšním moku.

Název v anglickém jazyce

Usage of Cerebrospinal Fluid for microRNA Analysis

Popis výsledku anglicky

Backgrounds: Deregulated levels of miRNAs, short noncod ing RNAs associated with pathogenesis of many dis eases, have been observed in cerebrospinal fl uid (CSF). Therefore, the analysis of CSF miRNAs in patients aff ected by tumors of central nervous system (CNS) might help to develop new dia gnostic platform enabl ing more precise dia gnosis. Thus, in our study we tried to optimize methodical approaches to be used for miRNA detection as RNA isolation and selection of suitable technology for global high-throughput miRNA profi ling. Material and Methods: In the optimization phase of RNA isolation from CSF, various commercially avail able kits with different protocol modifi cations were compared. Two quantitative polymerase chain reaction panels and Next Generation Sequenc ing method were tested for selection of the most suitable method for miRNA comprehensive profi ling. Results: The Urine miRNA Purifi cation kit (Norgen) and Next Generation Sequenc ing was selected as the most suitable kit for RNA extraction from CSF and method for miRNA comprehensive profi ling, resp. Conclusion: We established a protocol for RNA isolation and miRNA comprehensive profi l ing in CSF clinical specimens.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

—

OECD FORD obor

30204 - Oncology

Projekt

—

Návaznosti

I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2018

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

Klinická onkologie

ISBN

—

ISSN

0862-495X

e-ISSN

neuvedeno

Počet stran výsledku

3

Strana od-do

"S158"-"S160"

Název nakladatele

Česká lékařská společnost J.E. Purkyně

Místo vydání

—

Místo konání akce

Brno

Datum konání akce

16. 5. 2018

Typ akce podle státní příslušnosti

CST - Celostátní akce

Kód UT WoS článku

—