Molekulárně genetická analýza polymorfismů a STR lokusů u pacientů s nemalobuněčným karcinomem plic
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11110%2F09%3A4890" target="_blank" >RIV/00216208:11110/09:4890 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/00064165:_____/09:4890
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
Molekulárně genetická analýza polymorfismů a STR lokusů u pacientů s nemalobuněčným karcinomem plic
Popis výsledku v původním jazyce
Na našem pracovišti jsem zavedli analýzu ztráty heterozygosity (LOH) pomocí krátkých tandemových repetic (STR, mikrosatelity), které jsou v blízkosti čtyř tumor supresorických genů TP53 (pentaTP53, diTP53), APC (D5S346, D5S318, D5S299, D5S82), FHIT (D3S1300) a VHL (D3S1560) jejichž mutace jsou často popisovány v buňkách plicní rakoviny. Uvedené STR jsme vyšetřovali ve volné plasmatické DNA (cell free DNA, cfDNA). Druhým přístupem byla analýza genomické DNA pro čtyři jednonukleotidové polymorfismy (SNP)v genech LOC123688 (rs931794, rs8034191), CHRNA3 (rs1051730) a CHRNA5 (rs16969968) umístěné na dlouhém raménku 15. chromozomu (15q24-q25) blízko genů pro podjednotky nikotinového acetylcholinového receptoru (nACHR), které byly nedávno popsány jako asociované s karcinomem plic.
Název v anglickém jazyce
Molecular genetic investigation of polymorfisms and STR loci in patients with nonsmall cell lung cancer
Popis výsledku anglicky
Short tandem repeats (STRs) located in/at TP53 (pentaTP53, diTP53), APC (D5S346, D5S318, D5S299, D5S82), FHIT (D3S1300) and VHL genes (D3S1560) were analyzed in plasma cell-free DNA (cfDNA), and, in parallel in genomic DNA, four single-nucleotide polymorphisms (SNPs) mapping to the region of nicotinic acetylcholine receptor subunit genes on 15q24-q25. Study was conducted to identify risk genetic factors in patients with nonsmall cell lung cancer (NSCLC), compared to individuals with non-tumor pulmonarydiseases, and anonymized blood samples from routine laboratory. We have studied loss of heterozygosity (LOH) in total cfDNA, genomic DNA of the same patient served us as a control. Further, we have introduced analysis of SNPs in genes: LOC123688 (rs931794, rs8034191), CHRNA3 (rs1051730) and CHRNA5 (rs16969968), recently shown to be associated with risk for lung cancer.
Klasifikace
Druh
D - Stať ve sborníku
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2009
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název statě ve sborníku
Sborník přednášek - Diagnostika a léčba nádorů plic a pleury
ISBN
978-80-254-5417-6
ISSN
—
e-ISSN
—
Počet stran výsledku
5
Strana od-do
—
Název nakladatele
Nemocnice České Budějovice
Místo vydání
České Budějovice
Místo konání akce
Český Krumlov
Datum konání akce
22. 10. 2009
Typ akce podle státní příslušnosti
CST - Celostátní akce
Kód UT WoS článku
—