Genome-wide association study of renal cell carcinoma identifies two susceptibility loci on 2p21 and 11q13.3
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11110%2F11%3A7401" target="_blank" >RIV/00216208:11110/11:7401 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/61989592:15110/11:10213568 RIV/00209805:_____/11:#0000170
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1038/ng.723" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1038/ng.723</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Genome-wide association study of renal cell carcinoma identifies two susceptibility loci on 2p21 and 11q13.3
Popis výsledku v původním jazyce
We conducted a two-stage genome-wide association study of renal cell carcinoma (RCC) in 3,772 affected individuals (cases) and 8,505 controls of European background from 11 studies and followed up 6 SNPs in 3 replication studies of 2,198 cases and 4,918controls. Two loci on the regions of 2p21 and 11q13.3 were associated with RCC susceptibility below genome-wide significance. Two correlated variants (r(2) = 0.99 in controls), rs11894252 (P = 1.8 x 10(-8)) and rs7579899 (P = 2.3 x 10(-9)), map to EPAS1on 2p21, which encodes hypoxia-inducible-factor-2 alpha, a transcription factor previously implicated in RCC. The second locus, rs7105934, at 11q13.3, contains no characterized genes (P = 7.8 x 10(-14)). In addition, we observed a promising association on 12q24.31 for rs4765623, which maps to SCARB1, the scavenger receptor class B, member 1 gene (P = 2.6 x 10(-8)). Our study reports previously unidentified genomic regions associated with RCC risk that may lead to new etiological insights
Název v anglickém jazyce
Genome-wide association study of renal cell carcinoma identifies two susceptibility loci on 2p21 and 11q13.3
Popis výsledku anglicky
We conducted a two-stage genome-wide association study of renal cell carcinoma (RCC) in 3,772 affected individuals (cases) and 8,505 controls of European background from 11 studies and followed up 6 SNPs in 3 replication studies of 2,198 cases and 4,918controls. Two loci on the regions of 2p21 and 11q13.3 were associated with RCC susceptibility below genome-wide significance. Two correlated variants (r(2) = 0.99 in controls), rs11894252 (P = 1.8 x 10(-8)) and rs7579899 (P = 2.3 x 10(-9)), map to EPAS1on 2p21, which encodes hypoxia-inducible-factor-2 alpha, a transcription factor previously implicated in RCC. The second locus, rs7105934, at 11q13.3, contains no characterized genes (P = 7.8 x 10(-14)). In addition, we observed a promising association on 12q24.31 for rs4765623, which maps to SCARB1, the scavenger receptor class B, member 1 gene (P = 2.6 x 10(-8)). Our study reports previously unidentified genomic regions associated with RCC risk that may lead to new etiological insights
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
V - Vyzkumna aktivita podporovana z jinych verejnych zdroju
Ostatní
Rok uplatnění
2011
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Nature Genetics
ISSN
1061-4036
e-ISSN
—
Svazek periodika
43
Číslo periodika v rámci svazku
1
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
8
Strana od-do
60-"U83"
Kód UT WoS článku
000285683500017
EID výsledku v databázi Scopus
—