Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Modelling mutational landscapes of human cancers in vitro

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11110%2F14%3A10331264" target="_blank" >RIV/00216208:11110/14:10331264 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1038/srep04482" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1038/srep04482</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1038/srep04482" target="_blank" >10.1038/srep04482</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Modelling mutational landscapes of human cancers in vitro

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Experimental models that recapitulate mutational landscapes of human cancers are needed to decipher the rapidly expanding data on human somatic mutations. We demonstrate that mutation patterns in immortalised cell lines derived from primary murine embryonic fibroblasts (MEFs) exposed in vitro to carcinogens recapitulate key features of mutational signatures observed in human cancers. In experiments with several cancer-causing agents we obtained high genome-wide concordance between human tumour mutation data and in vitro data with respect to predominant substitution types, strand bias and sequence context. Moreover, we found signature mutations in well-studied human cancer driver genes. To explore endogenous mutagenesis, we used MEFs ectopically expressing activation-induced cytidine deaminase (AID) and observed an excess of AID signature mutations in immortalised cell lines compared to their non-transgenic counterparts. MEF immortalisation is thus a simple and powerful strategy for modelling cancer mutation landscapes that facilitates the interpretation of human tumour genome-wide sequencing data.

  • Název v anglickém jazyce

    Modelling mutational landscapes of human cancers in vitro

  • Popis výsledku anglicky

    Experimental models that recapitulate mutational landscapes of human cancers are needed to decipher the rapidly expanding data on human somatic mutations. We demonstrate that mutation patterns in immortalised cell lines derived from primary murine embryonic fibroblasts (MEFs) exposed in vitro to carcinogens recapitulate key features of mutational signatures observed in human cancers. In experiments with several cancer-causing agents we obtained high genome-wide concordance between human tumour mutation data and in vitro data with respect to predominant substitution types, strand bias and sequence context. Moreover, we found signature mutations in well-studied human cancer driver genes. To explore endogenous mutagenesis, we used MEFs ectopically expressing activation-induced cytidine deaminase (AID) and observed an excess of AID signature mutations in immortalised cell lines compared to their non-transgenic counterparts. MEF immortalisation is thus a simple and powerful strategy for modelling cancer mutation landscapes that facilitates the interpretation of human tumour genome-wide sequencing data.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    FD - Onkologie a hematologie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2014

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Scientific Reports

  • ISSN

    2045-2322

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    4

  • Číslo periodika v rámci svazku

    March

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    8

  • Strana od-do

  • Kód UT WoS článku

    000333460500003

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-84905382541