Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

HPV Status and Mutation Analysis Using Multiparallel Sequencing in Distal Oesophageal and Gastro-oesophageal Junction Adenocarcinomas

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11120%2F18%3A43917214" target="_blank" >RIV/00216208:11120/18:43917214 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/00216208:11150/18:10382054 RIV/61989592:15110/18:73590242 RIV/00179906:_____/18:10382054 RIV/00064173:_____/18:N0000062

  • Výsledek na webu

    <a href="https://fb.cuni.cz/file/5867/fb2018a0007.pdf" target="_blank" >https://fb.cuni.cz/file/5867/fb2018a0007.pdf</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    HPV Status and Mutation Analysis Using Multiparallel Sequencing in Distal Oesophageal and Gastro-oesophageal Junction Adenocarcinomas

  • Popis výsledku v původním jazyce

    The incidence of adenocarcinoma of oesophagus or gastro-oesophageal junction is increasing in Europe and other regions of the Western world. Research of possible causes has shifted to the molecular level. This study evaluated human papillomavirus (HPV) using real-time PCR and mutational status of selected genes using the multiparallel sequencing method (NGS) in DNA extracted from paraffin-embedded tumour tissue of 56 patients with oesophageal or gastro-oesophageal junction adenocarcinoma. The genetic material was in sufficient quality for the analysis in 37 cases (66 %). No HPV-positive sample was found. NGS revealed higher frequency of mutations in TP53, ARID1A, PIK3CA, SMAD4, ERBB2, MSH6, BRCA2, and RET genes. Association between gene mutations and histological grade, subtype according to Lauren, or primary tumour site was not statistically significant. In conclusion, the study did not confirm any HPV-positive sample of oesophageal and gastro-oesophageal junction adenocarcinoma. The study confirmed the usefulness of NGS analysis of paraffin-embedded tissue of these tumours, and it could be used in clinical studies to evaluate the prognostic and/or predictive value of the tested mutations. The association between gene mutations and histological features should be tested in larger patient cohorts.

  • Název v anglickém jazyce

    HPV Status and Mutation Analysis Using Multiparallel Sequencing in Distal Oesophageal and Gastro-oesophageal Junction Adenocarcinomas

  • Popis výsledku anglicky

    The incidence of adenocarcinoma of oesophagus or gastro-oesophageal junction is increasing in Europe and other regions of the Western world. Research of possible causes has shifted to the molecular level. This study evaluated human papillomavirus (HPV) using real-time PCR and mutational status of selected genes using the multiparallel sequencing method (NGS) in DNA extracted from paraffin-embedded tumour tissue of 56 patients with oesophageal or gastro-oesophageal junction adenocarcinoma. The genetic material was in sufficient quality for the analysis in 37 cases (66 %). No HPV-positive sample was found. NGS revealed higher frequency of mutations in TP53, ARID1A, PIK3CA, SMAD4, ERBB2, MSH6, BRCA2, and RET genes. Association between gene mutations and histological grade, subtype according to Lauren, or primary tumour site was not statistically significant. In conclusion, the study did not confirm any HPV-positive sample of oesophageal and gastro-oesophageal junction adenocarcinoma. The study confirmed the usefulness of NGS analysis of paraffin-embedded tissue of these tumours, and it could be used in clinical studies to evaluate the prognostic and/or predictive value of the tested mutations. The association between gene mutations and histological features should be tested in larger patient cohorts.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    30204 - Oncology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/EF16_013%2F0001674" target="_blank" >EF16_013/0001674: BBMRI-CZ: Síť biobank - univerzální platforma k výzkumu etiopatogeneze chorob</a><br>

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2018

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Folia Biologica

  • ISSN

    0015-5500

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    64

  • Číslo periodika v rámci svazku

    2

  • Stát vydavatele periodika

    CZ - Česká republika

  • Počet stran výsledku

    5

  • Strana od-do

    41-45

  • Kód UT WoS článku

    000447784300002

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85055080296