ShinySOM: Graphical SOM-based analysis of single-cell cytometry data
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11130%2F19%3A10406843" target="_blank" >RIV/00216208:11130/19:10406843 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/00216208:11320/19:10406843 RIV/61388963:_____/20:00524674 RIV/68407700:21230/20:00341747 RIV/00216208:11320/20:10406843
Výsledek na webu
<a href="https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=vnLhNWwfIf" target="_blank" >https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=vnLhNWwfIf</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btaa091" target="_blank" >10.1093/bioinformatics/btaa091</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
ShinySOM: Graphical SOM-based analysis of single-cell cytometry data
Popis výsledku v původním jazyce
ShinySOM offers a user-friendly interface for reproducible, high-throughput analysis of high-dimensional flow and mass cytometry data guided by self-organizing maps. The software implements a FlowSOM-style workflow, with improvements in performance, visualizations and data dissection possibilities. The outputs of the analysis include precise statistical information about the dissected samples, and R-compatible metadata useful for batch processing of large sample volumes.
Název v anglickém jazyce
ShinySOM: Graphical SOM-based analysis of single-cell cytometry data
Popis výsledku anglicky
ShinySOM offers a user-friendly interface for reproducible, high-throughput analysis of high-dimensional flow and mass cytometry data guided by self-organizing maps. The software implements a FlowSOM-style workflow, with improvements in performance, visualizations and data dissection possibilities. The outputs of the analysis include precise statistical information about the dissected samples, and R-compatible metadata useful for batch processing of large sample volumes.
Klasifikace
Druh
J<sub>ost</sub> - Ostatní články v recenzovaných periodicích
CEP obor
—
OECD FORD obor
10600 - Biological sciences
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2019
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Bioinformatics
ISSN
1367-4803
e-ISSN
—
Svazek periodika
2020
Číslo periodika v rámci svazku
January
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
2
Strana od-do
—
Kód UT WoS článku
—
EID výsledku v databázi Scopus
—