ShinySOM: graphical SOM-based analysis of single-cell cytometry data

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61388963%3A_____%2F20%3A00524674" target="_blank" >RIV/61388963:_____/20:00524674 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/00216208:11320/19:10406843 RIV/00216208:11130/19:10406843 RIV/68407700:21230/20:00341747 RIV/00216208:11320/20:10406843

Výsledek na webu

<a href="https://academic.oup.com/bioinformatics/article/36/10/3288/5734646" target="_blank" >https://academic.oup.com/bioinformatics/article/36/10/3288/5734646</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btaa091" target="_blank" >10.1093/bioinformatics/btaa091</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

ShinySOM: graphical SOM-based analysis of single-cell cytometry data

Popis výsledku v původním jazyce

ShinySOM offers a user-friendly interface for reproducible, high-throughput analysis of high-dimensional flow and mass cytometry data guided by self-organizing maps. The software implements a FlowSOM-style workflow, with improvements in performance, visualizations and data dissection possibilities. The outputs of the analysis include precise statistical information about the dissected samples, and R-compatible metadata useful for the batch processing of large sample volumes.nAvailability and implementation: ShinySOM is free and open-source, available online at gitlab.com/exaexa/ShinySOM.

Název v anglickém jazyce

ShinySOM: graphical SOM-based analysis of single-cell cytometry data

Popis výsledku anglicky

ShinySOM offers a user-friendly interface for reproducible, high-throughput analysis of high-dimensional flow and mass cytometry data guided by self-organizing maps. The software implements a FlowSOM-style workflow, with improvements in performance, visualizations and data dissection possibilities. The outputs of the analysis include precise statistical information about the dissected samples, and R-compatible metadata useful for the batch processing of large sample volumes.nAvailability and implementation: ShinySOM is free and open-source, available online at gitlab.com/exaexa/ShinySOM.

Druh

J_imp - Článek v periodiku v databázi Web of Science

CEP obor

—

OECD FORD obor

10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)

Projekt

—

Návaznosti

I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2020

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Bioinformatics

ISSN

1367-4803

e-ISSN

—

Svazek periodika

36

Číslo periodika v rámci svazku

10

Stát vydavatele periodika

GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

Počet stran výsledku

2

Strana od-do

3288-3289

Kód UT WoS článku

000537447900056

EID výsledku v databázi Scopus

2-s2.0-85084696156