Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Large-scale targeted sequencing identifies risk genes for neurodevelopmental disorders

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11130%2F20%3A10415876" target="_blank" >RIV/00216208:11130/20:10415876 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/00064203:_____/20:10415876

  • Výsledek na webu

    <a href="https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=pOKgGU_Uj8" target="_blank" >https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=pOKgGU_Uj8</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1038/s41467-020-18723-y" target="_blank" >10.1038/s41467-020-18723-y</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Large-scale targeted sequencing identifies risk genes for neurodevelopmental disorders

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Most genes associated with neurodevelopmental disorders (NDDs) were identified with an excess of de novo mutations (DNMs) but the significance in case-control mutation burden analysis is unestablished. Here, we sequence 63 genes in 16,294 NDD cases and an additional 62 genes in 6,211 NDD cases. By combining these with published data, we assess a total of 125 genes in over 16,000 NDD cases and compare the mutation burden to nonpsychiatric controls from ExAC. We identify 48 genes (25 newly reported) showing significant burden of ultra-rare (MAF &lt; 0.01%) gene-disruptive mutations (FDR 5%), six of which reach family-wise error rate (FWER) significance (p &lt; 1.25E-06). Among these 125 targeted genes, we also reevaluate DNM excess in 17,426 NDD trios with 6,499 new autism trios. We identify 90 genes enriched for DNMs (FDR 5%; e.g., GABRG2 and UIMC1); of which, 61 reach FWER significance (p &lt; 3.64E-07; e.g., CASZ1). In addition to doubling the number of patients for many NDD risk genes, we present phenotype-genotype correlations for seven risk genes (CTCF, HNRNPU, KCNQ3, ZBTB18, TCF12, SPEN, and LEO1) based on this large-scale targeted sequencing effort.

  • Název v anglickém jazyce

    Large-scale targeted sequencing identifies risk genes for neurodevelopmental disorders

  • Popis výsledku anglicky

    Most genes associated with neurodevelopmental disorders (NDDs) were identified with an excess of de novo mutations (DNMs) but the significance in case-control mutation burden analysis is unestablished. Here, we sequence 63 genes in 16,294 NDD cases and an additional 62 genes in 6,211 NDD cases. By combining these with published data, we assess a total of 125 genes in over 16,000 NDD cases and compare the mutation burden to nonpsychiatric controls from ExAC. We identify 48 genes (25 newly reported) showing significant burden of ultra-rare (MAF &lt; 0.01%) gene-disruptive mutations (FDR 5%), six of which reach family-wise error rate (FWER) significance (p &lt; 1.25E-06). Among these 125 targeted genes, we also reevaluate DNM excess in 17,426 NDD trios with 6,499 new autism trios. We identify 90 genes enriched for DNMs (FDR 5%; e.g., GABRG2 and UIMC1); of which, 61 reach FWER significance (p &lt; 3.64E-07; e.g., CASZ1). In addition to doubling the number of patients for many NDD risk genes, we present phenotype-genotype correlations for seven risk genes (CTCF, HNRNPU, KCNQ3, ZBTB18, TCF12, SPEN, and LEO1) based on this large-scale targeted sequencing effort.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10600 - Biological sciences

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/NV17-29423A" target="_blank" >NV17-29423A: Analýza genetických variant asociovaných s mentální retardaci a poruchami autistického spektra s využitím sekvenování nové generace</a><br>

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2020

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Nature Communications [online]

  • ISSN

    2041-1723

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    11

  • Číslo periodika v rámci svazku

    1

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    13

  • Strana od-do

    4932

  • Kód UT WoS článku

    000577113300012

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85091936481