Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

NGS better discriminates true MRD positivity for the risk stratification of childhood ALL treated on MRD-based protocol

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11130%2F23%3A10448807" target="_blank" >RIV/00216208:11130/23:10448807 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/00064203:_____/23:10448807

  • Výsledek na webu

    <a href="https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=S0MZUQyBdb" target="_blank" >https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=S0MZUQyBdb</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1182/blood.2022017003" target="_blank" >10.1182/blood.2022017003</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    NGS better discriminates true MRD positivity for the risk stratification of childhood ALL treated on MRD-based protocol

  • Popis výsledku v původním jazyce

    We compared minimal residual disease (MRD) levels evaluated by routinely used real-time quantitative PCR (qPCR) patient-specific assays and by next generation sequencing (NGS) approach in 780 immunoglobulin/T-cell receptor (IG/TR) markers in 432 children with B-cell precursor acute lymphoblastic leukemia (ALL) treated on the AIEOP-BFM ALL 2009 protocol. Our aim was to compare the MRD-based risk stratification at the end of induction (EOI). The results were concordant in 639/780 (81.9%) of these markers, 37/780 (4.7%) markers were detected only by NGS. In 104/780 (13.3%) markers positive only by qPCR, a large fraction (23/104; 22.1%) was detected also by NGS, however, due to the presence of identical IG/TR rearrangements in unrelated samples, we classified those as nonspecific/falsely-positive. Risk group stratification based on the MRD results by qPCR and NGS at EOI was concordant in 76% of the patients, 19% of the patients would be assigned to a lower-risk group by NGS, largely due to the elimination of false-positive qPCR results, and 5% of patients would be assigned to a higher risk group by NGS. NGS MRD is highly concordant with qPCR while providing more specific results and can be an alternative in the frontline MRD evaluation in forthcoming MRD-based protocols.

  • Název v anglickém jazyce

    NGS better discriminates true MRD positivity for the risk stratification of childhood ALL treated on MRD-based protocol

  • Popis výsledku anglicky

    We compared minimal residual disease (MRD) levels evaluated by routinely used real-time quantitative PCR (qPCR) patient-specific assays and by next generation sequencing (NGS) approach in 780 immunoglobulin/T-cell receptor (IG/TR) markers in 432 children with B-cell precursor acute lymphoblastic leukemia (ALL) treated on the AIEOP-BFM ALL 2009 protocol. Our aim was to compare the MRD-based risk stratification at the end of induction (EOI). The results were concordant in 639/780 (81.9%) of these markers, 37/780 (4.7%) markers were detected only by NGS. In 104/780 (13.3%) markers positive only by qPCR, a large fraction (23/104; 22.1%) was detected also by NGS, however, due to the presence of identical IG/TR rearrangements in unrelated samples, we classified those as nonspecific/falsely-positive. Risk group stratification based on the MRD results by qPCR and NGS at EOI was concordant in 76% of the patients, 19% of the patients would be assigned to a lower-risk group by NGS, largely due to the elimination of false-positive qPCR results, and 5% of patients would be assigned to a higher risk group by NGS. NGS MRD is highly concordant with qPCR while providing more specific results and can be an alternative in the frontline MRD evaluation in forthcoming MRD-based protocols.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    30205 - Hematology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/NU20-03-00284" target="_blank" >NU20-03-00284: Imunomonitoring pomocí přestaveb genů pro receptory antigenů ve vztahu k léčebné odpovědi u nádorových onemocnění</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2023

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Blood

  • ISSN

    0006-4971

  • e-ISSN

    1528-0020

  • Svazek periodika

    141

  • Číslo periodika v rámci svazku

    5

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    5

  • Strana od-do

    529-533

  • Kód UT WoS článku

    000935173600001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85145607891