Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Potential and pitfalls of whole transcriptome-based immunogenetic marker identification in acute lymphoblastic leukemia; a EuroMRD and EuroClonality-NGS Working Group study

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00064203%3A_____%2F21%3A10424834" target="_blank" >RIV/00064203:_____/21:10424834 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/00216208:11130/21:10424834 RIV/00216224:14740/21:00124268

  • Výsledek na webu

    <a href="https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=OxQhlsPKoP" target="_blank" >https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=OxQhlsPKoP</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1038/s41375-021-01154-z" target="_blank" >10.1038/s41375-021-01154-z</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Potential and pitfalls of whole transcriptome-based immunogenetic marker identification in acute lymphoblastic leukemia; a EuroMRD and EuroClonality-NGS Working Group study

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Identification of immunoglobulin (IG) and T-cell receptor (TR) gene rearrangements in acute lymphoblastic leukemia (ALL) patients at initial presentation is crucial for monitoring of minimal residual disease (MRD) during subsequent follow-up and thereby for appropriate risk-group stratification. In a diagnostic setting, IG/TR gene rearrangements are generally identified using DNA-based PCR analysis, followed by classical Sanger sequencing or next generation sequencing (NGS).Nowadays, whole transcriptome RNA sequencing (RNAseq) is frequently used to identify fusion genes and to assign patients into distinct molecular subgroups according to WHO 2016 classification, or for protocol-based clinical decisions. Hence, it would be beneficial if RNAseq data could also be used for the identification of IG/TR gene rearrangements pertaining to the leukemic clone.

  • Název v anglickém jazyce

    Potential and pitfalls of whole transcriptome-based immunogenetic marker identification in acute lymphoblastic leukemia; a EuroMRD and EuroClonality-NGS Working Group study

  • Popis výsledku anglicky

    Identification of immunoglobulin (IG) and T-cell receptor (TR) gene rearrangements in acute lymphoblastic leukemia (ALL) patients at initial presentation is crucial for monitoring of minimal residual disease (MRD) during subsequent follow-up and thereby for appropriate risk-group stratification. In a diagnostic setting, IG/TR gene rearrangements are generally identified using DNA-based PCR analysis, followed by classical Sanger sequencing or next generation sequencing (NGS).Nowadays, whole transcriptome RNA sequencing (RNAseq) is frequently used to identify fusion genes and to assign patients into distinct molecular subgroups according to WHO 2016 classification, or for protocol-based clinical decisions. Hence, it would be beneficial if RNAseq data could also be used for the identification of IG/TR gene rearrangements pertaining to the leukemic clone.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    30205 - Hematology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2021

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Leukemia

  • ISSN

    0887-6924

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    35

  • Číslo periodika v rámci svazku

    3

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    5

  • Strana od-do

    924-928

  • Kód UT WoS článku

    000619689600001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85102608202