Prp45 Affects Prp22 Partition in Spliceosomal Complexes and Splicing Efficiency of Non-Consensus Substrates
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11310%2F09%3A00013036" target="_blank" >RIV/00216208:11310/09:00013036 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Prp45 Affects Prp22 Partition in Spliceosomal Complexes and Splicing Efficiency of Non-Consensus Substrates
Popis výsledku v původním jazyce
Prp45 is an yeast ortholog of Human transcription co-regulator SNW1/SKIP, which is implicated in the regulation of both transcription elongation and alternative splicing. We characterize a temperature sensitive allele of PRP45 using a synthetic lethalityscreen, TAP purification and primer extension splicing assay. We found that prp45(1?169) genetically interacts spliceosomal components SYF1, CLF1/SYF3, NTC20, and CEF1, SLU7, PRP17, PRP18, and PRP22. Spliceosomal complexes purified from prp45(1?169) cells showed decreased stoichiometry of Prp22, suggesting its deranged interaction with the spliceosome. Splicing of canonical intron was unimpeded, wheras mutants showed elevated levels of lariatexon intermediate. We suggest that Prp45 contributes to splicing efficiency of substrates non-conforming to the consensus.
Název v anglickém jazyce
Prp45 Affects Prp22 Partition in Spliceosomal Complexes and Splicing Efficiency of Non-Consensus Substrates
Popis výsledku anglicky
Prp45 is an yeast ortholog of Human transcription co-regulator SNW1/SKIP, which is implicated in the regulation of both transcription elongation and alternative splicing. We characterize a temperature sensitive allele of PRP45 using a synthetic lethalityscreen, TAP purification and primer extension splicing assay. We found that prp45(1?169) genetically interacts spliceosomal components SYF1, CLF1/SYF3, NTC20, and CEF1, SLU7, PRP17, PRP18, and PRP22. Spliceosomal complexes purified from prp45(1?169) cells showed decreased stoichiometry of Prp22, suggesting its deranged interaction with the spliceosome. Splicing of canonical intron was unimpeded, wheras mutants showed elevated levels of lariatexon intermediate. We suggest that Prp45 contributes to splicing efficiency of substrates non-conforming to the consensus.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach
Ostatní
Rok uplatnění
2009
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Journal of Cellular Biochemistry
ISSN
0730-2312
e-ISSN
—
Svazek periodika
106
Číslo periodika v rámci svazku
1
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
13
Strana od-do
—
Kód UT WoS článku
000262238600016
EID výsledku v databázi Scopus
—