Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Transcriptomic identification of iron-regulated and iron-independent gene copies within the heavily duplicated Trichomonas vaginalis genome

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11310%2F12%3A10123557" target="_blank" >RIV/00216208:11310/12:10123557 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://gbe.oxfordjournals.org/content/early/2012/09/12/gbe.evs078.full.pdf+html" target="_blank" >http://gbe.oxfordjournals.org/content/early/2012/09/12/gbe.evs078.full.pdf+html</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1093/gbe/evs078" target="_blank" >10.1093/gbe/evs078</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Transcriptomic identification of iron-regulated and iron-independent gene copies within the heavily duplicated Trichomonas vaginalis genome

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Gene duplication is an important evolutionary mechanism and no eukaryote has more duplicated gene families than the parasitic protist Trichomonas vaginalis. Iron is an essential nutrient for Trichomonas and plays a pivotal role in the establishment of infection, proliferation, and virulence. To gain insight into the role of iron in T. vaginalis gene expression and genome evolution, we screened iron-regulated genes using an oligonucleotide microarray for T. vaginalis and by comparative EST (expressed sequence tag) sequencing of cDNA libraries derived from trichomonads cultivated under iron-rich (+Fe) and iron-restricted (-Fe) conditions. Among 19,000 ESTs from both libraries we identified 336 iron-regulated genes, of which 165 were upregulated under +Feconditions and 171 under -Fe conditions. The microarray analysis revealed that 195 of 4,950 unique genes were differentially expressed. Of these, 117 genes were upregulated under +Fe conditions, and 78 were upregulated under -Fe conditio

  • Název v anglickém jazyce

    Transcriptomic identification of iron-regulated and iron-independent gene copies within the heavily duplicated Trichomonas vaginalis genome

  • Popis výsledku anglicky

    Gene duplication is an important evolutionary mechanism and no eukaryote has more duplicated gene families than the parasitic protist Trichomonas vaginalis. Iron is an essential nutrient for Trichomonas and plays a pivotal role in the establishment of infection, proliferation, and virulence. To gain insight into the role of iron in T. vaginalis gene expression and genome evolution, we screened iron-regulated genes using an oligonucleotide microarray for T. vaginalis and by comparative EST (expressed sequence tag) sequencing of cDNA libraries derived from trichomonads cultivated under iron-rich (+Fe) and iron-restricted (-Fe) conditions. Among 19,000 ESTs from both libraries we identified 336 iron-regulated genes, of which 165 were upregulated under +Feconditions and 171 under -Fe conditions. The microarray analysis revealed that 195 of 4,950 unique genes were differentially expressed. Of these, 117 genes were upregulated under +Fe conditions, and 78 were upregulated under -Fe conditio

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    EE - Mikrobiologie, virologie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/LC07032" target="_blank" >LC07032: Centrum funkční genetiky</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2012

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Genome Biology and Evolution

  • ISSN

    1759-6653

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    4

  • Číslo periodika v rámci svazku

    10

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    13

  • Strana od-do

    1017-1029

  • Kód UT WoS článku

    000313213800002

  • EID výsledku v databázi Scopus