Vše
Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Effects of post-mortem and physical degradation on RNA integrity and quality

Popis výsledku

Identifikátory výsledku

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Effects of post-mortem and physical degradation on RNA integrity and quality

  • Popis výsledku v původním jazyce

    The precision and reliability of quantitative nucleic acid analysis depends on the quality of the sample analyzed and the integrity of the nucleic acids. The integrity of RNA is currently primarily assessed by the analysis of ribosomal RNA, which is the by far dominant species. The extrapolation of these results to mRNAs and microRNAs, which are structurally quite different, is questionable. Here we show that ribosomal and some nucleolar and mitochondrial RNAs, are highly resistant to naturally occurring post-mortem degradation, while mRNAs, although showing substantial internal variability, are generally much more prone to nucleolytic degradation. In contrast, all types of RNA show the same sensitivity to heat. Using qPCR assays targeting different regions of mRNA molecules, we find no support for 5' or 3' preferentiality upon post-mortem degradation.

  • Název v anglickém jazyce

    Effects of post-mortem and physical degradation on RNA integrity and quality

  • Popis výsledku anglicky

    The precision and reliability of quantitative nucleic acid analysis depends on the quality of the sample analyzed and the integrity of the nucleic acids. The integrity of RNA is currently primarily assessed by the analysis of ribosomal RNA, which is the by far dominant species. The extrapolation of these results to mRNAs and microRNAs, which are structurally quite different, is questionable. Here we show that ribosomal and some nucleolar and mitochondrial RNAs, are highly resistant to naturally occurring post-mortem degradation, while mRNAs, although showing substantial internal variability, are generally much more prone to nucleolytic degradation. In contrast, all types of RNA show the same sensitivity to heat. Using qPCR assays targeting different regions of mRNA molecules, we find no support for 5' or 3' preferentiality upon post-mortem degradation.

Klasifikace

  • Druh

    JSC - Článek v periodiku v databázi SCOPUS

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10600 - Biological sciences

Návaznosti výsledku

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2015

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Biomolecular Detection and Quantification [online]

  • ISSN

    2214-7535

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    2015

  • Číslo periodika v rámci svazku

    5

  • Stát vydavatele periodika

    DE - Spolková republika Německo

  • Počet stran výsledku

    7

  • Strana od-do

    3-9

  • Kód UT WoS článku

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-84943627995