Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Sequencing of the genus Arabidopsis identifies a complex history of nonbifurcating speciation and abundant trans-specific polymorphism

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11310%2F16%3A10330276" target="_blank" >RIV/00216208:11310/16:10330276 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1038/ng.3617" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1038/ng.3617</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1038/ng.3617" target="_blank" >10.1038/ng.3617</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Sequencing of the genus Arabidopsis identifies a complex history of nonbifurcating speciation and abundant trans-specific polymorphism

  • Popis výsledku v původním jazyce

    The notion of species as reproductively isolated units related through a bifurcating tree implies that gene trees should generally agree with the species tree and that sister taxa should not share polymorphisms unless they diverged recently and should be equally closely related to outgroups. It is now possible to evaluate this model systematically. We sequenced multiple individuals from 27 described taxa representing the entire Arabidopsis genus. Cluster analysis identified seven groups, corresponding to described species that capture the structure of the genus. However, at the level of gene trees, only the separation of Arabidopsis thaliana from the remaining species was universally supported, and, overall, the amount of shared polymorphism demonstrated that reproductive isolation was considerably more recent than the estimated divergence times. We uncovered multiple cases of past gene flow that contradict a bifurcating species tree. Finally, we showed that the pattern of divergence differs between gene ontologies, suggesting a role for selection.

  • Název v anglickém jazyce

    Sequencing of the genus Arabidopsis identifies a complex history of nonbifurcating speciation and abundant trans-specific polymorphism

  • Popis výsledku anglicky

    The notion of species as reproductively isolated units related through a bifurcating tree implies that gene trees should generally agree with the species tree and that sister taxa should not share polymorphisms unless they diverged recently and should be equally closely related to outgroups. It is now possible to evaluate this model systematically. We sequenced multiple individuals from 27 described taxa representing the entire Arabidopsis genus. Cluster analysis identified seven groups, corresponding to described species that capture the structure of the genus. However, at the level of gene trees, only the separation of Arabidopsis thaliana from the remaining species was universally supported, and, overall, the amount of shared polymorphism demonstrated that reproductive isolation was considerably more recent than the estimated divergence times. We uncovered multiple cases of past gene flow that contradict a bifurcating species tree. Finally, we showed that the pattern of divergence differs between gene ontologies, suggesting a role for selection.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    EF - Botanika

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/GAP506%2F12%2F0668" target="_blank" >GAP506/12/0668: Trendy v evoluci polyploidních komplexů: obdobné nebo odlišné příběhy u třech skupin z čeledi Brassicaceae?</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2016

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Nature Genetics

  • ISSN

    1061-4036

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    48

  • Číslo periodika v rámci svazku

    9

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    9

  • Strana od-do

    1077-1085

  • Kód UT WoS článku

    000382398800021

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-84978732423