Protocol A protocol for in vivo RNA labeling and visualization in tobacco pollen tubes
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11310%2F24%3A10497145" target="_blank" >RIV/00216208:11310/24:10497145 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=JfTCSK18Zo" target="_blank" >https://verso.is.cuni.cz/pub/verso.fpl?fname=obd_publikace_handle&handle=JfTCSK18Zo</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.xpro.2024.103433" target="_blank" >10.1016/j.xpro.2024.103433</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Protocol A protocol for in vivo RNA labeling and visualization in tobacco pollen tubes
Popis výsledku v původním jazyce
Here, we present a protocol for labeling and live visualization of RNA-protein complexes in the form of ribonucleoprotein particles (RNPs) in tobacco pollen tubes. We describe steps for constructing RNA-pp7/MS2 tag and biolistic gene-gun-mediated pollen transformation. We then provide detailed procedures for RNA labeling using PP7 aptamer nascent RNA tagging and a fluorescently labeled Pseudomonas aeruginosa PP7 bacteriophage coat protein (PCP) reporter that binds to PP7 RNA stem loops. This protocol is adaptable to other cell types by employing tissue-specific promoters.
Název v anglickém jazyce
Protocol A protocol for in vivo RNA labeling and visualization in tobacco pollen tubes
Popis výsledku anglicky
Here, we present a protocol for labeling and live visualization of RNA-protein complexes in the form of ribonucleoprotein particles (RNPs) in tobacco pollen tubes. We describe steps for constructing RNA-pp7/MS2 tag and biolistic gene-gun-mediated pollen transformation. We then provide detailed procedures for RNA labeling using PP7 aptamer nascent RNA tagging and a fluorescently labeled Pseudomonas aeruginosa PP7 bacteriophage coat protein (PCP) reporter that binds to PP7 RNA stem loops. This protocol is adaptable to other cell types by employing tissue-specific promoters.
Klasifikace
Druh
J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science
CEP obor
—
OECD FORD obor
10611 - Plant sciences, botany
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2024
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
STAR Protocols
ISSN
2666-1667
e-ISSN
2666-1667
Svazek periodika
5
Číslo periodika v rámci svazku
4
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
14
Strana od-do
103433
Kód UT WoS článku
001359602900001
EID výsledku v databázi Scopus
2-s2.0-85209077161