Target-Oriented Generic Fingerprint-Based Molecular Representation
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11320%2F14%3A10292650" target="_blank" >RIV/00216208:11320/14:10292650 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Target-Oriented Generic Fingerprint-Based Molecular Representation
Popis výsledku v původním jazyce
The screening of chemical libraries is an important step in the drug discovery process. The existing chemical libraries contain up to millions of compounds. As the screening at such scale is expensive, the virtual screening is often utilized. There existseveral variants of virtual screening and ligand-based virtual screening is one of them. It utilizes the similarity of screened chemical compounds to known compounds. Besides the employed similarity measure, another aspect greatly influencing the performance of ligand-based virtual screening is the chosen chemical compound representation. In this paper, we introduce a fragment-based representation of chemical compounds. Our representation utilizes fragments to represent a compound where each fragment is represented by its physico-chemical descriptors. The representation is highly parametrizable, especially in the area of physico-chemical descriptors selection and application. In order to test the performance of our method, we utilized
Název v anglickém jazyce
Target-Oriented Generic Fingerprint-Based Molecular Representation
Popis výsledku anglicky
The screening of chemical libraries is an important step in the drug discovery process. The existing chemical libraries contain up to millions of compounds. As the screening at such scale is expensive, the virtual screening is often utilized. There existseveral variants of virtual screening and ligand-based virtual screening is one of them. It utilizes the similarity of screened chemical compounds to known compounds. Besides the employed similarity measure, another aspect greatly influencing the performance of ligand-based virtual screening is the chosen chemical compound representation. In this paper, we introduce a fragment-based representation of chemical compounds. Our representation utilizes fragments to represent a compound where each fragment is represented by its physico-chemical descriptors. The representation is highly parametrizable, especially in the area of physico-chemical descriptors selection and application. In order to test the performance of our method, we utilized
Klasifikace
Druh
D - Stať ve sborníku
CEP obor
IN - Informatika
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/GP14-29032P" target="_blank" >GP14-29032P: Efektivní explorace chemického prostoru s využitím vícekriteriální optimalizace</a><br>
Návaznosti
S - Specificky vyzkum na vysokych skolach
Ostatní
Rok uplatnění
2014
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název statě ve sborníku
Computer Science & Information Technology
ISBN
978-1-921987-18-2
ISSN
—
e-ISSN
—
Počet stran výsledku
14
Strana od-do
231-244
Název nakladatele
AIRCC Publishing
Místo vydání
Neuveden
Místo konání akce
Sydney, Australia
Datum konání akce
27. 12. 2014
Typ akce podle státní příslušnosti
WRD - Celosvětová akce
Kód UT WoS článku
—