Molekulární interakce kolicinu U se svým imunitním proteinem.

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14110%2F05%3A00013200" target="_blank" >RIV/00216224:14110/05:00013200 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Molekulární interakce kolicinu U se svým imunitním proteinem.

Popis výsledku v původním jazyce

Přes sekvenční podobnost kolicinů U a Y nejsou producenti kolicinů U a Y zkříženě imunní. Pro studium protein-proteinových interakcí mezi kolicinem a jeho imunitním proteinem jsme zkonstruovali sedm hybridních genů pro kolicin U/Y. Pro interakci kolicinuU s jeho imunitním proteinem je klíčový aminokyselinový zbytek G580. Navíc v rekognici imunitního proteinu kolicinem U hraje významnou roli aminokyselinový zbytek F576. Třetí interakční místo je distálně od Spe I místa kolicinového genu (v 34 aminokyselinách na C-konci - z nichž je u kolicinu U a Y 12 rozdílných). Oproti tomu u kolicinu Y jsou pro tutéž interakci významné aminokyselinové zbytky V590 a Y586. Menší význam pro interakci kolicinu Y s imunitním proteinem má také aminokyselinový zbytek A594a/nebo A595. I zde se předpokládá vliv interakčního místa v C-terminálních 34 aminokyselinách.

Název v anglickém jazyce

Molecular interaction of colicin U with its immunity protein

Popis výsledku anglicky

The colicin-immunity protein recognition is a suitable model for studying protein-protein interactions. There are 34 amino acid residues different between sequences of colicin U a Y in these pore-forming bactericidal domains. Almost all different amino acid residues in the pore forming domain were mutated by site-directed mutagenesis to the corresponding sequence of colicin Y (U). More than 40 mutant colicins were prepared and their toxic effect was tested on the sensitive bacteria transformed with plasmid harboring either cui (colicin U immunity) gene or cyi (colicin Y immunity) gene. Colicin U variants with point mutations in the hydrophobic hairpin, F576Y and G580V, were significantly less recognized by Cui, in addition to colicin U with K609R mutation localized downstream of hydrophobic hairpin. In the colicin Y pore-forming domain, Y586 and A589 were identified as interaction sites with Cyi in the hydrophobic hairpin, in addition to A577-I578 in the helix 8 of colicin Y pore formi

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/GA310%2F03%2F1091" target="_blank" >GA310/03/1091: Mapování interakce kolicinů s citlivou a imunní bakteriální buňkou: receptorové studie a inaktivace kolicinu jeho imunitním proteinem</a><br>

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2005

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

Chemické listy 99

ISBN

—

ISSN

0009-2770

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

1

Strana od-do

—

Název nakladatele

ČCHS

Místo vydání

ČR

Místo konání akce

Devět skal ? Žďárské vrchy

Datum konání akce

15. 6. 2005

Typ akce podle státní příslušnosti

CST - Celostátní akce

Kód UT WoS článku

—