Identifikace a charakterizace sigma-54 závislých promotorů Treponema pallidum.

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14110%2F06%3A00016081" target="_blank" >RIV/00216224:14110/06:00016081 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Identifikace a charakterizace sigma-54 závislých promotorů Treponema pallidum.

Popis výsledku v původním jazyce

Spirocheta T. pallidum ssp. pallidum je původcem syfilis, pohlavního onemocnění charakterizovaného více stádii a postižením různých orgánů. Je tedy pravděpodobné, že T. pallidum mění expresi svých genů během infekce lidského hostitele. Studovali jsme funkci faktoru sigma-54 (RpoN) a jeho promotorů. Funkcí sigma faktorů je vazba RNA?polymerázy k promotoru a specifická iniciace transkripce. Pro studium promotorů závislých na faktoru sigma-54 byla použita analýza in silico pomocí programu PromScan a transkripční fúze mezi promotory a geny luxCDABE plazmidu pCS26. Za přítomnosti dalšího plazmidu nesoucího treponemální gen pro sigma-54 (rpoN) můžeme pomocí tohoto systému analyzovat funkci jednotlivých predikovaných promotorů. Výsledky potvrzují přítomnost sigma-54 závislých promotorů v genomu T. pallidum Nichols. Treponemální faktor sigma-54 je částečně zaměnitelný s escherichiálním faktorem sigma-54, a proto je vhodné experimenty provádět v kmenech rpoN-.

Název v anglickém jazyce

Identification and characterization of sigma-54-dependent promoters of Treponema pallidum.

Popis výsledku anglicky

The spirochete T. pallidum ssp. pallidum is the causative agent of syphilis, a sexually transmitted disease characterized by multiple stages and infection of different organs. It was hypothesized that T. pallidum regulates its gene expression during infection of humans. We have studied the function of sigma-54 factor (RpoN) and sigma-54-dependent promoters. Sigma factors inititate transcription by binding to promoter and to RNA-polymerase. The sigma-54-dependent promoters were identified by the PromScansoftware. pCS26 plasmid was used for the construction of the transcriptional fusions between the promoters and luxCDABE genes. This reporter system was used for verification of identified promoters. The promoters of polA and tpF1 genes were shown to bedependent on overexpression of treponemal rpoN and fhlA both in wild type E. coli and, more extensively, in E. coli rpoN- or E. coli fhlA-. Regulation of polA and tpF1 genes was confirmed using Q-PCR technique.

Druh

O - Ostatní výsledky

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2006

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů