Analýza sigma-54 závislých promotorů spirochety Treponema pallidum.

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14110%2F06%3A00016085" target="_blank" >RIV/00216224:14110/06:00016085 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Analýza sigma-54 závislých promotorů spirochety Treponema pallidum.

Popis výsledku v původním jazyce

Cíl: Studium funkce faktoru sigma-54 (RpoN) a jeho promotorů. Potvrzení regulace genové exprese u původce syfilis, Treponema pallidum ssp. pallidum. V genomu T. pallidum ssp. pallidum Nichols byly pomocí programu Promscan identifikovány geny, které majípromotory rozpoznávané faktorem sigma-54. Jsou to: TP0105, TP0324, TP0689, TP0816, TP1035 a TP1038. Promotory genů TP0105, TP0501 (negativní kontrola) a TP1038 byly naklonovány do vektoru pCS26. Ve wt kmenech E. coli DH10B byla bazální transkripce z těchto promotorů příliš vysoká, proto byl tento reportérový systém přenesen do kmenů E. coli rpoN- nebo E. coli fhlA-. Vzniklé konstrukty byly dále transformovány rekombinantními plazmidy nesoucími treponemální geny TP0111 (rpoN) a TP0082 (fhlA). Po indukciexprese genů rpoN a fhlA dochází u promotorů genů TP0105 (polA) a TP1038 (tpF1) k signifikantnímu vzrůstu luminiscence oproti kontrolám.

Název v anglickém jazyce

Analysis of sigma-54 dependent promoters in Treponema pallidum.

Popis výsledku anglicky

Genes rpoN (coding for sigma 54 factor) and fhlA (coding for putative transcriptional activator) were cloned into the arabinose-inducible expression vector pBAD/HisB. Q-PCR technique was used for the study of putative gene regulation mediated by RpoN andFhlA in the clones of the BAC library. sigma 54-dependent promoters were identified in the T. pallidum genome using in silico approach and the predicted transcripts were mapped by PCR technique. Two possible sigma 54-dependent promoters (in the three BAC clones used) were identified by the software Promscan. Promoters were predicted upstream of sigA (TP1012) and TpF1 genes and transcript starts were confirmed by PCR amplifications. The experimental findings of the hlyIII and TpF1 (both organized in oneoperon) and sigA were in agreement with in silico analysis. Proteins RpoN and FhlA are positive regulators of gene expression of several treponemal genes.

Druh

O - Ostatní výsledky

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2006

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů