Restrikční mapování blízce příbuzných spirochet rodu Treponema.
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14110%2F06%3A00016084" target="_blank" >RIV/00216224:14110/06:00016084 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
Restrikční mapování blízce příbuzných spirochet rodu Treponema.
Popis výsledku v původním jazyce
Cíl: Stanovit rozdíly mezi genomy čtyř blízce příbuzných spirochet rodu Treponema metodou DNA fingerprintingu. Materiál a metody: Byly vyšetřeny kmeny Nichols, SS14 (T. p. pallidum), Samoan D (T. p. pertenue) a Cuniculi A (T. paraluiscuniculi). Na základě kompletní nukleotidové sekvence kmene Nichols byly genomy vybraných zástupců rozděleny do 97 překrývajících se intervalů; intervaly byly amplifikovány a štěpeny restrikčními enzymy BamH I, EcoR I a Hind III. Restrikční profily jednotlivých kmenů byly srovnány a použity k identifikaci heterologních oblastí. Rozdíly v genomech byly soustředěny zejména do skupiny tpr genů a do skupiny hypotetických genů, které se nacházejí v jejich blízkosti. Ukazuje to na možnost, že rozdílná virulence treponemálních kmenů je podmíněna relativně malými odlišnostmi v příslušných genomech. Identifikovaných nukleotidových záměn lze využít při molekulární identifikaci treponemálních kmenů a izolátů.
Název v anglickém jazyce
Restriction mapping of closely related treponemal genomes
Popis výsledku anglicky
Whole genome fingerprinting was used to compare four treponemal strains including Nichols and SS14 (T. p. pallidum), Samoan D (T. p. pertenue) and Cuniculi A (T. paraluiscuniculi). T. p. pallidum is the causative agent of sexually transmitted syphilis, T. p. pertenue causes endemic non-venereal treponemal infections and T. paraluiscuniculi is the etiologic agent of venereal syphilis in rabbits and does not infect humans. The different degrees of invasivity and pathogenicity of these strains should correspond to the differences in their genomes. The genomes of analysed strains were divided into 97 overlapping intervals covering the whole genome and each of these segments was amplified and digested by restriction enzymes BamH I, EcoR I and Hind III. Thegenome differences are preferentially localized in the vicinity of tpr genes.
Klasifikace
Druh
O - Ostatní výsledky
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2006
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů