Bacteriocin of strain Yersinia frederiksenii 27601
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14110%2F09%3A00038443" target="_blank" >RIV/00216224:14110/09:00038443 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
slovinština
Název v původním jazyce
Bakteriocín kmeňa Yersinia frederiksenii 27601
Popis výsledku v původním jazyce
Vyšetrili sme 53 nepatogénnych kmeňov rodu Yersinia na produkciu antibakteriálnych agens. Bolo identifikovaných šesť producentských kmeňov, pričom antibakteriálne agens produkované Y. frederiksenii bolo podrobené dôkladnejšej analýze. Jedná sa o bakteriocín proteínovej povahy so špecifickým spektrom účinku na baktérie príbuzných druhov rodu Yersinia. Schopnosť produkovať bakteriocín je nesená na plazmide pYF27601 (5574 bp), vyznačujúcom sa zreteľným stupňom homológie ku Col plazmidom. Boli identifikované dva gény bakteriocinogénie - gén pre vlastný bakteriocín YF (1316 bp) a gén pre imunitný proteín bakteriocínu YF (338 bp). Pomocou sekvenčnej analýzy bola pre daný gén bakteriocínu stanovená homológia s génmi pre alveicín A a B, kolicín Ia a Ib, pyocíntypu S a kolicín E1. Proteínový bakteriocín Y. fredericksenii je novým druhom bakteriocínu, ktorý selektívne pôsobí na kmene rodu Yersinia. Navrhujeme pomenovanie kolicín F.
Název v anglickém jazyce
Bacteriocin of strain Yersinia frederiksenii 27601
Popis výsledku anglicky
In a cross-test experiment, we investigated the ability of 53 nonpathogenic strains of the genus Yersinia to produce antibacterial agents. We identified six bacteriocin producers. Bacteriocin of Y. fredericksenii 27601 was further analyzed. The identified bacteriocin of Y. fredericksenii 27601 is a protein with specific antibacterial activity on bacteria belonging to the related strains of the genus Yersinia. Bacteriocin and immunity protein encoding genes were identified on the plasmid pYF27601. Plasmid pYF27601 showed high degree of homology to Col-plasmids and its sequencing revealed gene encoding bacteriocin (1317 bp) and immunity protein gene (338 bp). Sequence analysis of the bacteriocin gene revealed homology to genes of alveicin A and alveicinB, colicins Ia and Ib, S-type pyocin and colicin E1. The above described bacteriocin of Y. fredericksenii is a new type of bacteriocin. We propose to denominate it as colicin FY.
Klasifikace
Druh
D - Stať ve sborníku
CEP obor
EE - Mikrobiologie, virologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/NS9665" target="_blank" >NS9665: Molekulární typizace bakteriocinů produkovaných kmeny Escherichia coli z klinického materiálu: identifikace kolicinů a mikrocinů v souborech komensálních a patogenních kmenů</a><br>
Návaznosti
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2009
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název statě ve sborníku
XIII. Setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků.
ISBN
978-80-210-4830-0
ISSN
—
e-ISSN
—
Počet stran výsledku
2
Strana od-do
—
Název nakladatele
Masarykova univerzita
Místo vydání
Brno
Místo konání akce
Brno
Datum konání akce
14. 4. 2009
Typ akce podle státní příslušnosti
CST - Celostátní akce
Kód UT WoS článku
—